RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532749.1

TMEM25-223, Transcript of transmembrane protein 25, human

TSL 4

Gene TMEM25, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM25-223	ENST00000532749	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749		K7EIM0	57 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	MT-CO2	P00403	227 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	IGHV3-48	P01763	117 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	LINC00869	P0C866	280 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	OR10J1	P30954	320 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	RND2	P52198	227 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	ZNF709	Q8N972	641 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	ACY3	Q96HD9	319 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	NUPR2	A6NF83	97 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	STPG3	Q8N7X2	389 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	NPIPB3	Q92617	1050 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	MB	P02144	154 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	M6PR	P20645	277 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	CCL20	P78556	96 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	MARC2	Q969Z3	335 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	THYN1	Q9P016	225 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	RAB19	A4D1S5	217 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	C8orf88	P0DMB2	117 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	B2M	P61769	119 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	SLC25A22	Q9H936	323 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TMEM25-223	ENST00000532749	DNAH2	Q9P225	4427 aa		10.46	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749		F8W735	103 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	S100A1	P23297	94 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	RAB31	Q13636	194 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	OR4X1	Q8NH49	305 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	TRGV9	Q99603	122 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749		A0A1B0GV50	99 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	CYB5B	O43169	146 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	TGOLN2	O43493	480 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	SPRY2	O43597	315 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	IGLC1	P0CG04	106 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	ZNF90	Q03938	601 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	TOR2A	Q5JU69	321 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	RAB24	Q969Q5	203 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	FAM210A	Q96ND0	272 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	ZFP92	A6NM28	416 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	CLN5	O75503	358 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	HBE1	P02100	147 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	APOC4	P55056	127 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	DEFB135	Q30KP9	77 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	UQCC3	Q6UW78	93 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	PKHD1	P08F94	4074 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749		C9JQL5	133 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	IGKV1-17	P01599	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMEM25-223	ENST00000532749	CD5	P06127	495 aa		10.42	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms