RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529030.1

PEX16-208, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 16, human

TSL 3

Gene PEX16, Length 794 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEX16-208	ENST00000529030	ORM2	P19652	201 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	ZNF266	Q14584	549 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	MGST2	Q99735	147 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	HMSD	A8MTL9	139 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	TAAR5	O14804	337 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	PLP1	P60201	277 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	PAFAH1B2	P68402	229 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	MFF	Q9GZY8	342 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	VSIR	Q9H7M9	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	SMLR1	H3BR10	107 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	ARPC5	O15511	151 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	ARL6	Q9H0F7	186 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	FBXL17	Q9UF56	701 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030		U3KQE9	123 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030		A0A0D9SG52	128 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	HELT	A6NFD8	242 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030		G3V3Q6	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	COX7A2P2	O60397	106 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	OR5G3	P0C626	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	B2M	P61769	119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	OPCML	Q14982	345 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	ST8SIA2	Q92186	375 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	PFDN5	Q99471	154 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	RNF2	Q99496	336 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	CSTL1	Q9H114	145 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PEX16-208	ENST00000529030	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030		A0A1B0GVG6	124 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	PRR20E	P86478	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	PRR20C	P86479	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	PRR20D	P86480	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	PRR20B	P86481	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	PRR20A	P86496	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	ZNF345	Q14585	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	TCF24	Q7RTU0	167 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	DOK5	Q9P104	306 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	BUB3	O43684	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	C1QB	P02746	253 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	MIC13	Q5XKP0	118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	HYLS1	Q96M11	299 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	GPR82	Q96P67	336 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	WFDC1	Q9HC57	220 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	ZNF98	A6NK75	572 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	ZNF124	Q15973	351 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	RARRES2	Q99969	163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	ARV1	Q9H2C2	271 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	GALR1	P47211	349 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	GLMP	Q8WWB7	406 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030		H3BRN7	92 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	PFDN1	O60925	122 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PEX16-208	ENST00000529030	C4BPB	P20851	252 aa		11.1	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms