RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517886.1

CHCHD10-203, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10, human

TSL 3

Gene CHCHD10, Length 494 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHCHD10-203	ENST00000517886	PRR20A	P86496	221 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	PSMG4	Q5JS54	123 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	MIC13	Q5XKP0	118 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	LEMD1	Q68G75	181 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	RCHY1	Q96PM5	261 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	UHRF2	Q96PU4	802 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	PFDN5	Q99471	154 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	ATP5S	Q99766	215 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		14.82	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	UBE2C	O00762	179 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	B2M	P61769	119 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	ZNF709	Q8N972	641 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	PSMB3	P49720	205 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	ZNF124	Q15973	351 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	PATE2	Q6UY27	113 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	STH	Q8IWL8	128 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	RSG1	Q9BU20	258 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	ISLR	O14498	428 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	IFNA5	P01569	189 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	C16orf92	Q96LL3	132 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CHCHD10-203	ENST00000517886	SOCS3	O14543	225 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886		Q6ZWC4	215 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	LINC00052	Q96N35	136 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	CSTL1	Q9H114	145 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	AQP10	Q96PS8	301 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	KNCN	A6PVL3	124 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	RETN	Q9HD89	108 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886		A0A087X0K7	114 aa		14.74	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		14.74	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		14.74	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	SPP1	P10451	314 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	CXCL2	P19875	107 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	ZNF266	Q14584	549 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886		Q5BKY6	102 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	RPRM	Q9NS64	109 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	HLA-DRB4	P13762	266 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	DEFB135	Q30KP9	77 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	LCN15	Q6UWW0	184 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	SPRY2	O43597	315 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	MORN5	Q5VZ52	161 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	C17orf77	Q96MU5	243 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	WFDC1	Q9HC57	220 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CHCHD10-203	ENST00000517886	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886		H3BMM0	161 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	FAM78B	Q5VT40	261 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	RNF183	Q96D59	192 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	HRH4	Q9H3N8	390 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	GUK1	Q16774	197 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	COL7A1	Q02388	2944 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	IGLC2	P0DOY2	106 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	C20orf173	Q96LM9	149 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	RNF222	A6NCQ9	220 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	RNF182	Q8N6D2	247 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CHCHD10-203	ENST00000517886	ZNF738	Q8NE65	137 aa		14.67	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms