RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514596.1

CTBP1-215, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 2

Gene CTBP1, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-215	ENST00000514596	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	ATP5S	Q99766	215 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	SLC25A22	Q9H936	323 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	COX7A2P2	O60397	106 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	PRR20E	P86478	221 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	PRR20C	P86479	221 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	PRR20D	P86480	221 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	PRR20B	P86481	221 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	PRR20A	P86496	221 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	HAGH	Q16775	308 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	ARV1	Q9H2C2	271 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	MEOX2	P50222	304 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	DEFB131A	P59861	70 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	B2M	P61769	119 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	MIC13	Q5XKP0	118 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596		Q6ZRG5	221 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF688	P0C7X2	276 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	IL17D	Q8TAD2	202 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	UHRF2	Q96PU4	802 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	PFDN5	Q99471	154 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CTBP1-215	ENST00000514596	APOC4	P55056	127 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	LEMD1	Q68G75	181 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	PATE2	Q6UY27	113 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	IFNA5	P01569	189 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	ID1	P41134	155 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	PSMB3	P49720	205 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF709	Q8N972	641 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	AQP10	Q96PS8	301 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	SOCS3	O14543	225 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF124	Q15973	351 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	PSMG4	Q5JS54	123 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	ISLR	O14498	428 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	STH	Q8IWL8	128 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	RSG1	Q9BU20	258 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596		A0A087X0K7	114 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	UBE2C	O00762	179 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF266	Q14584	549 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596		Q5BKY6	102 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	C16orf92	Q96LL3	132 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CTBP1-215	ENST00000514596	AGRN	O00468	2067 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	CXCL2	P19875	107 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	MORN5	Q5VZ52	161 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596		Q6ZWC4	215 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	C17orf77	Q96MU5	243 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	KNCN	A6PVL3	124 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596		G3V3Q6	166 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	LCN15	Q6UWW0	184 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	LINC00052	Q96N35	136 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	CSTL1	Q9H114	145 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	SPP1	P10451	314 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	HLA-DRB4	P13762	266 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21

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