RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HIGD1AQ9Y241 93 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV10A0A0B4J240 114 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H3BRN7 92 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00869P0C866 280 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PXDC1Q5TGL8 231 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM78BQ5VT40 261 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF709Q8N972 641 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV6A0A075B6T7 132 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM189A5PLL7 270 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A8MTW9 85 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 F6UB75 175 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEDDO75618 318 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL7P18124 248 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q6ZTC4 211 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C20orf173Q96LM9 149 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCRT1Q9BWW7 348 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUDT15Q9NV35 164 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DOK5Q9P104 306 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APLNQ9ULZ1 77 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLL5B9A064 214 aa12.1□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR5G3P0C626 314 aa12.1□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FXYD7P58549 80 aa12.1□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARL16Q0P5N6 197 aa12.1□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GSG1LQ6UXU4 331 aa12.1□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 S100ZQ8WXG8 99 aa12.1□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC35B3Q9H1N7 401 aa12.1□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BIRC6Q9NR09 4857 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 L7N2F9 121 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCSO14618 274 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H2AFB2P0C5Z0 115 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VAMP2P63027 116 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C12orf74Q32Q52 190 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PATE2Q6UY27 113 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF546Q86UE3 836 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C2orf50Q96LR7 162 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEC22CQ9BRL7 303 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARL6Q9H0F7 186 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CELA1Q9UNI1 258 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C5orf51A6NDU8 294 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM25EA8MYX2 175 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOSR2O14653 212 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MZT2BQ6NZ67 158 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UHRF2Q96PU4 802 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF126Q9BV68 326 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARV1Q9H2C2 271 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RFNGQ9Y644 331 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A087X0K7 114 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGPAT2O15120 278 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AMBPP02760 352 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGL1Q08830 312 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC38A11Q08AI6 406 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AMTNQ6UX39 209 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C11orf1Q9H5F2 150 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KMT2AQ03164 3969 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa12.06□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa12.06□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCAP31P51572 246 aa12.06□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL15RAQ13261 267 aa12.06□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASAH1Q13510 395 aa12.06□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB31Q13636 194 aa12.06□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa12.06□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HBE1P02100 147 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CXCL3P19876 107 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAV2P51636 162 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNN1P51911 297 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGFL4Q6B9Z1 124 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00305Q7Z4B0 112 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF182Q8N6D2 247 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CXCL2P19875 107 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSG3Q16557 428 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF767PQ75MW2 155 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF738Q8NE65 137 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR11H7Q8NGC8 314 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC20Q8TCA0 184 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MGST2Q99735 147 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DKK2Q9UBU2 259 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM24AA6NFZ4 105 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A6NHS1 94 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CST7O76096 145 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 S100A11P31949 105 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAMLGP49069 296 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SULT1A1P50225 295 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EMP1P54849 157 aa12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.9 ms