RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 ASCL2Q99929 193 aa10.3□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 ARL6Q9H0F7 186 aa10.3□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 WFDC10AQ9H1F0 79 aa10.3□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 SLC39A9Q9NUM3 307 aa10.3□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa10.29□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 A0A087X0K7 114 aa10.29□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 TFPI2P48307 235 aa10.29□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 PSMB3P49720 205 aa10.29□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM41BQ5BJD5 291 aa10.29□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 AQP10Q96PS8 301 aa10.29□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 PFDN5Q99471 154 aa10.29□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 CSTL1Q9H114 145 aa10.29□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 CLEC5AQ9NY25 188 aa10.29□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 UBQLN2Q9UHD9 624 aa10.29□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 OR5G3P0C626 314 aa10.28□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 CXCL2P19875 107 aa10.28□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 MIC13Q5XKP0 118 aa10.28□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00305Q7Z4B0 112 aa10.28□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 APRG1Q8IVJ8 170 aa10.28□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 PPP1R14BQ96C90 147 aa10.28□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa10.28□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 ATP5SQ99766 215 aa10.28□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.28□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 SLC25A32Q9H2D1 315 aa10.28□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 MBD2Q9UBB5 411 aa10.28□□□□□ -0.76
HDLBP-240ENST00000484412 A8MTW9 85 aa10.27□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 B2MP61769 119 aa10.27□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 C10orf113Q5VZT2 155 aa10.27□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa10.27□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 RNF183Q96D59 192 aa10.27□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 RCHY1Q96PM5 261 aa10.27□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 RSG1Q9BU20 258 aa10.27□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 KCNIP2Q9NS61 270 aa10.27□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 COL7A1Q02388 2944 aa10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 C17orf112F2Z3M2 114 aa10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF253O75346 499 aa10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 SPP1P10451 314 aa10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 Q5BKY6 102 aa10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 UHRF2Q96PU4 802 aa10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 OVOL2Q9BRP0 275 aa10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 HRH4Q9H3N8 390 aa10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 EDA2RQ9HAV5 297 aa10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM14CQ9P0S9 112 aa10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10.26□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 H3BMM0 161 aa10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 IFNA5P01569 189 aa10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF688P0C7X2 276 aa10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 FGF7P21781 194 aa10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 GUK1Q16774 197 aa10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 FOXI2Q6ZQN5 318 aa10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF709Q8N972 641 aa10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 SCRT1Q9BWW7 348 aa10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 SLC25A22Q9H936 323 aa10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 TIMM9Q9Y5J7 89 aa10.25□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 G3V3Q6 166 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 COX7A2P2O60397 106 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 HLA-DRB4P13762 266 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF266Q14584 549 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF124Q15973 351 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 PSMG4Q5JS54 123 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 STHQ8IWL8 128 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 WFDC1Q9HC57 220 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 RPRMQ9NS64 109 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 DOK5Q9P104 306 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 TNFSF18Q9UNG2 199 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.24□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 SPRY2O43597 315 aa10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 IGLC2P0DOY2 106 aa10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 CLINT1Q14677 625 aa10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 LEMD1Q68G75 181 aa10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 LCN15Q6UWW0 184 aa10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 Q6ZNX1 250 aa10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 OR2T35Q8NGX2 323 aa10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 SCGB1C1Q8TD33 95 aa10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 C16orf92Q96LL3 132 aa10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 SLC50A1Q9BRV3 221 aa10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 HMSDA8MTL9 139 aa10.22□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 TAAR5O14804 337 aa10.22□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 SERF2P84101 59 aa10.22□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 MORN5Q5VZ52 161 aa10.22□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa10.22□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 A0A0J9YX75 114 aa10.21□□□□□ -0.77
HDLBP-240ENST00000484412 RNF222A6NCQ9 220 aa10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms