RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF345Q14585 488 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 TMUB2Q71RG4 321 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 MGST2Q99735 147 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 GINS3Q9BRX5 216 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 ARL6Q9H0F7 186 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.56□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 SPRY2O43597 315 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 IL4P05112 153 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 RNF183Q96D59 192 aa8.55□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 NPPCP23582 126 aa8.54□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 RNF125Q96EQ8 232 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.54□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 RABAC1Q9UI14 185 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.53□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 BCL2L11O43521 198 aa8.53□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 STPG3Q8N7X2 389 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.53□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.53□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 COX7A2P2O60397 106 aa8.52□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 B2MP61769 119 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 S100A7AQ86SG5 101 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 SMPXQ9UHP9 88 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 A0A1W2PS18 150 aa8.51□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 PLP1P60201 277 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.51□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.51□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 RFNGQ9Y644 331 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 CHEK1O14757 476 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 LY6G6CO95867 125 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 CD5P06127 495 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 DEFB135Q30KP9 77 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 PFDN5Q99471 154 aa8.5□□□□□ -1.05
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