RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 PLP1P60201 277 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 CSTL1Q9H114 145 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 ZMAT4Q9H898 229 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 PRRG2O14669 202 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 TCF21O43680 179 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 GP9P14770 177 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 BSPH1Q075Z2 132 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 ATMQ13315 3056 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 OTORQ9NRC9 128 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 VWC2LB2RUY7 222 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 FCN3O75636 299 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 OR5AL1P0C617 328 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 FAM87AP0C7U9 286 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 DLX6P56179 175 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 SEC61GP60059 68 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 PAX2Q02962 417 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 DUX5Q96PT3 197 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 C1RLQ9NZP8 487 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 AKAP13Q12802 2813 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 NDUFB8O95169 186 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 LEPROTL1O95214 131 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 IGLL1P15814 213 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 COL8A1P27658 744 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 ZNF738Q8NE65 137 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 RITA1Q96K30 269 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 ST20Q9HBF5 79 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 CTSZQ9UBR2 303 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 A0A0G2JNJ9 132 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 OR4C46A6NHA9 309 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 ZNF785A8K8V0 405 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 PTTG1IPP53801 180 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 LYZP61626 148 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 GTSF1Q8WW33 167 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 NRGNQ92686 78 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 Q9UFV3 132 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 CRYBA4P53673 196 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 Q86TA4 180 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 H3BTX0 84 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 CRYGBP07316 175 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 LEMD1Q68G75 181 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 HAX1O00165 279 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 APELAP0DMC3 54 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 PSG1P11464 419 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 PRNTQ86SH4 94 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 MUC15Q8N387 334 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 COX11Q9Y6N1 276 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 ZNF292O60281 2723 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 RELNP78509 3460 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 RBP4P02753 201 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 THBDP07204 575 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 HTR1DP28221 377 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 RIGQ13278 110 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PKP4-210ENST00000480171 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.92□□□□□ -1.3
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