RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 A0A1W2PP11 408 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 C15orf65H3BRN8 121 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 MT-ND6P03923 174 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 AADACP22760 399 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 PSMB3P49720 205 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ARFRP1Q13795 201 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 KISS1Q15726 138 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 MSMO1Q15800 293 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 RNF151Q2KHN1 245 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 NIT1Q86X76 327 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 OR10V1Q8NGI7 309 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 C10orf35Q96D05 121 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 RITA1Q96K30 269 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TM2D1Q9BX74 207 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 RETNQ9HD89 108 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 GNG13Q9P2W3 67 aa5.98□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 A0A087WW49 117 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 CORTO00230 105 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 VDAC1P21796 283 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 BATFQ16520 125 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 Q6ZN92 141 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SAXO1Q8IYX7 474 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 STPG4Q8N801 248 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM56Q96MV1 263 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 RAB40CQ96S21 281 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TNCP24821 2201 aa5.97□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 PDE6DO43924 150 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF253O75346 499 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 HYPMO75409 117 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 SCGB1D2O95969 90 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 MOSP00540 346 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 IGLV1-40P01703 118 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 IGF1P05019 195 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 TSPOP30536 169 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF134P52741 427 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 HBG1P69891 147 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 HBG2P69892 147 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 MMDQ15546 238 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 VAMP3Q15836 100 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 ADIRFQ15847 76 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 ECSCRQ19T08 205 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 SPATA45Q537H7 98 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 WDR73Q6P4I2 378 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 Q6ZWC4 215 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF575Q86XF7 245 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 KCNK15Q9H427 330 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 EPM2AB3EWF7 344 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 DIRC3C9JPN6 131 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 H0Y980 276 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 IGHV3-11P01762 117 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 HLA-DRB1P01911 266 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 CRISP2P16562 243 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 GZMHP20718 246 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 PIGPP57054 158 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 RHOBP62745 196 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 RUNX1Q01196 453 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 ID3Q02535 119 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.95□□□□□ -1.46
SZRD1-208ENST00000476423 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms