RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 CAMLGP49069 296 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 BAXQ07812 192 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 ARL16Q0P5N6 197 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 RARRES2Q99969 163 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 RPRMQ9NS64 109 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 TENM2Q9NT68 2774 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 C16orf92Q96LL3 132 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 PFDN5Q99471 154 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 RSG1Q9BU20 258 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 ARV1Q9H2C2 271 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 H3BMM0 161 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 SOCS3O14543 225 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 COX7A2P2O60397 106 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 HLA-DRB4P13762 266 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 LINC00052Q96N35 136 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 MGST2Q99735 147 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 DOK5Q9P104 306 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 LYSTQ99698 3801 aa9.77□□□□□ -0.84
PRAME-211ENST00000476336 A0A087X0K7 114 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 IGSF23A1L1A6 192 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 KNCNA6PVL3 124 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 SIX6O95475 246 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 CXCL2P19875 107 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 H2BFSP57053 126 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 OR11H2Q8NH07 326 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 AGRNO00468 2067 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 MPC2O95563 127 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 PRR20EP86478 221 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 PRR20CP86479 221 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 PRR20DP86480 221 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 PRR20BP86481 221 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 PRR20AP86496 221 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 ASB13Q8WXK3 278 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 UHRF2Q96PU4 802 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 A0A0J9YWU9 116 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 MIFP14174 115 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 B2MP61769 119 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 GUK1Q16774 197 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 LCN15Q6UWW0 184 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 PATE2Q6UY27 113 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 ZNF709Q8N972 641 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 MFFQ9GZY8 342 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 FGF7P21781 194 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 NHLH2Q02577 135 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 FGL1Q08830 312 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 OPCMLQ14982 345 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 A0A0J9YX75 114 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 LCE6AA0A183 80 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 NUPR2A6NF83 97 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 H0YIZ8 118 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 AMBPP02760 352 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 PSG9Q00887 426 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 MIC13Q5XKP0 118 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 THAP6Q8TBB0 222 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 MED28Q9H204 178 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 HRH4Q9H3N8 390 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 ALG5Q9Y673 324 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 C4BPBP20851 252 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 RGS21Q2M5E4 152 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-211ENST00000476336 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms