RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 Q9UF83 564 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAV2A0A0B4J234 112 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 NDUFAF8A1L188 74 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 H3BNG1 76 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 SSNA1O43805 119 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 ORC5O43913 435 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 HPGDSO60760 199 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 HPRT1P00492 218 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 GYPBP06028 91 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 CT45A10P0DMU9 189 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 PRKACGP22612 351 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 G0S2P27469 103 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 CAV2P51636 162 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 RIDAP52758 137 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 FXYD6P3P58550 94 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 CXCR4P61073 352 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAM1Q15629 374 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF726P1Q15940 193 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 MORN2Q502X0 79 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 GCSAMLQ5JQS6 135 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 CNIH2Q6PI25 160 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 CBLN2Q8IUK8 224 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFP82Q8N141 532 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF664Q8N3J9 261 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 OR10R2Q8NGX6 335 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 OR2T4Q8NH00 348 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 C7orf33Q8WU49 177 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 PTH2Q96A98 100 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 YIPF6Q96EC8 236 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 PGLYRP4Q96LB8 373 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 AMBNQ9NP70 447 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 KLF12Q9Y4X4 402 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 V9GY05 133 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKRD65E5RJM6 399 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 H3BMM0 161 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 K7EQG2 157 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 FABP7O15540 132 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 YIF1AO95070 293 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 PTTG1O95997 202 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 HBZP02008 142 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 RLN2P04090 185 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 CD5P06127 495 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 FABP1P07148 127 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 LIMS3P0CW19 117 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 LIMS4P0CW20 117 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 TCP1P17987 556 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 CELP19835 753 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 PHBP35232 272 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 CBX5P45973 191 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 RBP2P50120 134 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 TAS2R31P59538 309 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 CYCSP99999 105 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 C10orf55Q5SWW7 151 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM162BQ5T6X4 162 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 UFSP1Q6NVU6 142 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 C10orf67Q8IYJ2 551 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 ARRDC1Q8N5I2 433 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 OR10J6PQ8NGY7 276 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM230Q96A57 120 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 TAMM41Q96BW9 452 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC25A38Q96DW6 304 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 Q96MT0 163 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 SPIN2AQ99865 258 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 OR51B2Q9Y5P1 312 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A0B4J2A0 478 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 A6NDN8 102 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 OR5AL1P0C617 328 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 DEFA4P12838 97 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 OR10A3P58181 314 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 MICAQ29983 383 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 ELP2Q6IA86 826 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 LYPD5Q6UWN5 251 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 IDO2Q6ZQW0 420 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms