RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 LAP3P28838 519 aa-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 DDTP30046 118 aa-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 SPRP35270 261 aaPredicted RBP-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 MAGEA11P43364 429 aa-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 DNASE1L1P49184 302 aa-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 RIDAP52758 137 aaKnown RBP-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 PIGPP57054 158 aa-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 FAM3AP98173 230 aa-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 GAGE1Q13065 139 aa-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 BIKQ13323 160 aa-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 SLC36A3Q495N2 470 aa-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 UNC50Q53HI1 259 aa-2.85□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 FBXO48Q5FWF7 155 aa-2.85□□□□□ -2.87
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SNORD54-201ENST00000459159 SH2D4BQ5SQS7 431 aa-2.85□□□□□ -2.87
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SNORD54-201ENST00000459159 OR4K5Q8NGD3 323 aa-2.85□□□□□ -2.87
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SNORD54-201ENST00000459159 DNAAF4Q8WXU2 420 aa-2.85□□□□□ -2.87
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SNORD54-201ENST00000459159 OR2M4Q96R27 311 aa-2.85□□□□□ -2.87
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SNORD54-201ENST00000459159 IDI2Q9BXS1 227 aa-2.85□□□□□ -2.87
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SNORD54-201ENST00000459159 DPPA2Q7Z7J5 298 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 RAB43Q86YS6 212 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 C10orf111Q8N326 155 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 FAM200AQ8TCP9 573 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 XAGE5Q8WWM1 108 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 ANAPC16Q96DE5 110 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 FAM81BQ96LP2 452 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC115Q96NT0 180 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 AQP10Q96PS8 301 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM175Q9BSA9 504 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 POLR3GLQ9BT43 218 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 C20orf24Q9BUV8 137 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP-2.86□□□□□ -2.87
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SNORD54-201ENST00000459159 THAP2Q9H0W7 228 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 BLZF1Q9H2G9 400 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP-2.86□□□□□ -2.87
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SNORD54-201ENST00000459159 FAM96AQ9H5X1 160 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM27Q9HBJ8 222 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 IL36GQ9NZH8 169 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 CLN8Q9UBY8 286 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 STEAP1Q9UHE8 339 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 AKT3Q9Y243 479 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 INSL5Q9Y5Q6 135 aa-2.86□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 TSPAN11A1L157 253 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 METTL21EPA6NDL7 271 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 H0Y8G0 127 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 M0R135 149 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 M0R2Z0 102 aa-2.87□□□□□ -2.87
SNORD54-201ENST00000459159 NDUFA1O15239 70 aa-2.87□□□□□ -2.87
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