RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 CST7O76096 145 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 MEOX2P50222 304 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB131AP59861 70 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 LYZP61626 148 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 LEMD1Q68G75 181 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZRG5 221 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF709Q8N972 641 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 CSTL1Q9H114 145 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 K7EQG2 157 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 HYPMO75409 117 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 JTBO76095 146 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 IFNA5P01569 189 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF688P0C7X2 276 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 GALR1P47211 349 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 CAMLGP49069 296 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF90Q03938 601 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 FCN2Q15485 313 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 VWC2Q2TAL6 325 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 DCANP1Q8TF63 244 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 RNF141Q8WVD5 230 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 GLMPQ8WWB7 406 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 PFDN5Q99471 154 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 MBD2Q9UBB5 411 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 U3KQE9 123 aa5.63□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 IGSF23A1L1A6 192 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 CXorf65A6NEN9 183 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 AGPAT2O15120 278 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 BUB3O43684 328 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 COX7A2P2O60397 106 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00869P0C866 280 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 ORM2P19652 201 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 CXCL3P19876 107 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 PLP1P60201 277 aa5.62□□□□□ -1.51
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SGMS1-201ENST00000361543 OR2F1Q13607 317 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 PMS2P11Q13670 270 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF266Q14584 549 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZNX1 250 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 STHQ8IWL8 128 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 OR8I2Q8N0Y5 310 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 OR1B1Q8NGR6 318 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5SQ99766 215 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 HSPB11Q9Y547 144 aa5.62□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 H0YIZ8 118 aa5.61□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 CCNKO75909 580 aa5.61□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
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SGMS1-201ENST00000361543 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 ARL16Q0P5N6 197 aa5.61□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.61□□□□□ -1.51
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SGMS1-201ENST00000361543 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 AQP10Q96PS8 301 aa5.61□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 RARRES2Q99969 163 aa5.61□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 RNF126Q9BV68 326 aa5.61□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 NRN1Q9NPD7 142 aa5.61□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 KMT2AQ03164 3969 aa5.61□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 NUPR2A6NF83 97 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF98A6NK75 572 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 KNCNA6PVL3 124 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 OR5G3P0C626 314 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 SPP1P10451 314 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 B2MP61769 119 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 CLINT1Q14677 625 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 OPCMLQ14982 345 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 ACTL10Q5JWF8 245 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 OR11H2Q8NH07 326 aa5.6□□□□□ -1.51
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