RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432588.5

ACTB-205, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-205ENST00000432588 COPRSQ9NQ92 184 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 HTTP42858 3142 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 GNAI3P08754 354 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 CETPP11597 493 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 PRDX5P30044 214 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 SNAPC2Q13487 334 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 PHKA1P46020 1223 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 PPIL2Q13356 520 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 ZBTB22O15209 634 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 TCP10Q12799 353 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 CCDC102BQ68D86 513 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 IRF6O14896 467 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 SRGAP3O43295 1099 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 PPATQ06203 517 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 USP40Q9NVE5 1235 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 CENPFP49454 3210 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 SLC34A2O95436 690 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 ADORA1P30542 326 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 SLF2Q8IX21 1173 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 TIMM10P62072 90 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 NFIAQ12857 509 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 MTX1Q13505 466 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 A0A1B0GUL7 405 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 BTBD19C9JJ37 291 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 TLR2O60603 784 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 INPP5BP32019 993 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 RASGRF1Q13972 1273 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 KIF22Q14807 665 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 ARMC5Q96C12 935 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 ABCF2Q9UG63 623 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 GNAI2P04899 355 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 TFCP2Q12800 502 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 TRIM27P14373 513 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 NBPF11Q86T75 865 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 XAGE2Q96GT9 111 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 IDI2Q9BXS1 227 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-205ENST00000432588 GAKO14976 1311 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 ENTPD3O75355 529 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 CAP1Q01518 475 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 GORABQ5T7V8 394 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 AK9Q5TCS8 1911 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 POTEFA5A3E0 1075 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 GNRH1P01148 92 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 RGS3P49796 1198 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 ANKRD23Q86SG2 305 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.797e-29■■□□□ 11.5
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ACTB-205ENST00000432588 ZFPM1Q8IX07 1006 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 PICK1Q9NRD5 415 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 PDHXO00330 501 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 BCAR3O75815 825 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 ZNF333Q96JL9 665 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 BRCA2P51587 3418 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 MYH2Q9UKX2 1941 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 CXCL11O14625 94 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 BTDP43251 543 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 PRMT2P55345 433 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 GSTO1P78417 241 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 MECOMQ03112 1051 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 RFX7Q2KHR2 1363 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-205ENST00000432588 ATRNL1Q5VV63 1379 aa19.96■□□□□ 0.79
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