RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HHIPL2Q6UWX4 724 aa12.54□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MOB2Q70IA6 237 aa12.54□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DEFB129Q9H1M3 183 aa12.54□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa12.54□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZAP70P43403 619 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 VEGFBP49765 207 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HUNKP57058 714 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MECOMQ03112 1051 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RASA3Q14644 834 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DEFB115Q30KQ5 88 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CYP4F22Q6NT55 531 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ERICH6Q7L0X2 663 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDAN1Q8IWY9 1227 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C2orf69Q8N8R5 385 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EXOC6Q8TAG9 804 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF384Q8TF68 577 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRRCC1Q9C099 1032 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RAI14Q9P0K7 980 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FZD1Q9UP38 647 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GAKO14976 1311 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NF2P35240 595 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TNFAIP1Q13829 316 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRKG1Q13976 671 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CAPNS2Q96L46 248 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MRIQ9BWK5 157 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DCTPP1Q9H773 170 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PPP4R2Q9NY27 417 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMOD2Q9NZR1 351 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PCNTO95613 3336 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FOCADQ5VW36 1801 aa12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYH7P12883 1935 aa12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BTDP43251 543 aa12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 JMYQ8N9B5 988 aa12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMEM39BQ9GZU3 492 aa12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRP2BPQ9P2M1 347 aa12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RFX7Q2KHR2 1363 aa12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AK9Q5TCS8 1911 aa12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TNNI2P48788 182 aa12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NFIAQ12857 509 aa12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANTXR1Q9H6X2 564 aa12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBE2Q2LH0YL09 131 aa12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AOC2O75106 756 aa12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IDH1O75874 414 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ECE1P42892 770 aa12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FKBP1BP68106 108 aa12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RGMBQ6NW40 437 aa12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLF2Q8IX21 1173 aa12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HHIPL1Q96JK4 782 aa12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TEPSINQ96N21 525 aa12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 USP40Q9NVE5 1235 aa12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GSTO1P78417 241 aa12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TCP10Q12799 353 aa12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TSHZ3Q63HK5 1081 aa12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ADGRA1Q86SQ6 560 aa12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM198AQ9UFP1 575 aa12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NAV1Q8NEY1 1877 aa12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SIPA1L1O43166 1804 aa12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GOLIM4O00461 696 aa12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLC10A3P09131 477 aa12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RGS3P49796 1198 aa12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PICALMQ13492 652 aa12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FKBP1CQ5VVH2 108 aa12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ARMC9Q7Z3E5 817 aa12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM83AQ86UY5 434 aa12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RASAL3Q86YV0 1011 aa12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MAGEB6Q8N7X4 407 aa12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BOLA2Q9H3K6 86 aa12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms