RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602698.5

HCG18-247, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 573 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-247ENST00000602698 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 PKHD1P08F94 4074 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 PRSS46E5RG02 174 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SYNGR2O43760 224 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 S100A5P33763 92 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ID1P41134 155 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 C12orf74Q32Q52 190 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 CCDC190Q86UF4 302 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 COQ8AQ8NI60 647 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 LINC00052Q96N35 136 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 NEU1Q99519 415 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 RNF126Q9BV68 326 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 CCDC160A6NGH7 325 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 WRBO00258 174 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ISLRO14498 428 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 IGKV3-20P01619 116 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 AMBPP02760 352 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 HOXB5P09067 269 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 FXYD7P58549 80 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ZNF709Q8N972 641 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 F6UB75 175 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 H3BP45 60 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 MEOX2P50222 304 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 PAX9P55771 341 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SRRQ9GZT4 340 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SLC25A22Q9H936 323 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 NACAE9PAV3 2078 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.85□□□□□ -1.31
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HCG18-247ENST00000602698 C9orf170A2RU37 121 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 TMEM189A5PLL7 270 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ZNF98A6NK75 572 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ADAP1O75689 374 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 NDUFB6O95139 128 aa6.85□□□□□ -1.31
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HCG18-247ENST00000602698 GALR1P47211 349 aa6.85□□□□□ -1.31
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HCG18-247ENST00000602698 AKR1C1Q04828 323 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 FAM78BQ5VT40 261 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 C16orf92Q96LL3 132 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 C20orf173Q96LM9 149 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 C17orf77Q96MU5 243 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 RPRMQ9NS64 109 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 RFNGQ9Y644 331 aa6.85□□□□□ -1.31
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HCG18-247ENST00000602698 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ORM2P19652 201 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 EMP1P54849 157 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 ID3Q02535 119 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 BAK1Q16611 211 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 GPR82Q96P67 336 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 RSG1Q9BU20 258 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 DOK5Q9P104 306 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 DKK2Q9UBU2 259 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-247ENST00000602698 PKD1P98161 4303 aa6.84□□□□□ -1.31
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