RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 UQCC3Q6UW78 93 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TOMM20LQ6UXN7 152 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 UHRF2Q96PU4 802 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFAND3Q9H8U3 227 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFA4O00483 81 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNA1P01562 189 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL20P78556 96 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF414Q96IQ9 312 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 NF1P21359 2839 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL14EPLP0DKL9 152 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 RABAC1Q9UI14 185 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD34BA5PLL1 514 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SMDT1Q9H4I9 107 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CUBNO60494 3623 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GUS0 222 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CLPSL1A2RUU4 121 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BRN7 92 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV12-3P01733 135 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 MANBALQ9NQG1 85 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM167BQ9NRX6 74 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A2Q9BXI2 301 aa23.89■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF114Q9Y508 228 aa23.89■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 OR7C2O60412 319 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 GCHFRP30047 84 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 GUK1Q16774 197 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 MORN5Q5VZ52 161 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 RBFOX3A6NFN3 312 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 I3L521 148 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PEA15Q15121 130 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 GPHB5Q86YW7 130 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 IQCF2Q8IXL9 164 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 C4orf3Q8WVX3 66 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CITED4Q96RK1 184 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 GNG13Q9P2W3 67 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PROK1P58294 105 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SUN5Q8TC36 379 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5B12Q96R08 314 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SCRT1Q9BWW7 348 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51M1Q9H341 326 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM14CQ9P0S9 112 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 BCL2P10415 239 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM106AQ4KMX7 169 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF503Q96F45 646 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL26Q96S19 204 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PAXXQ9BUH6 204 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV5A0A0B4J249 113 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF98A6NK75 572 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CD5P06127 495 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TOR2AQ5JU69 321 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF506Q5JVG8 444 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM190Q8WZ59 177 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V1G1O75348 118 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TXNDC17Q9BRA2 123 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 NPPCP23582 126 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYBB3P26998 211 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 HAGHQ16775 308 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 RPEL1Q2QD12 228 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 VAX2Q9UIW0 290 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ZP3P21754 424 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 C2CD3Q4AC94 2353 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 C20orf24Q9BUV8 137 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 K7EMT4 169 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 GP9P14770 177 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf194Q5T5A4 169 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR82Q96P67 336 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 U3KQE9 123 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 HAX1O00165 279 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL7P18124 248 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 FXYD5Q96DB9 178 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TREM1Q9NP99 234 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 BUB3O43684 328 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CD28P10747 220 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ICAM4Q14773 271 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 LEMD1Q68G75 181 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 RARRES2Q99969 163 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087WW49 117 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALS9O00182 355 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10J4P0C629 311 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-206ENST00000588815 PYYP10082 97 aa23.77■■□□□ 1.4
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