RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CNTFRP26992 372 aa20.12■□□□□ 0.81
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CAPNS1-204ENST00000587718 PATE2Q6UY27 113 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST3H2BBQ8N257 126 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-204ENST00000587718 MISP3Q96FF7 219 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51M1Q9H341 326 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa20.12■□□□□ 0.81
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CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV2-8P01709 118 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1B1Q8NGR6 318 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR61Q9BZJ8 451 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-204ENST00000587718 NIT2Q9NQR4 276 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-204ENST00000587718 FXYD3Q14802 87 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-204ENST00000587718 KLF12Q9Y4X4 402 aa20■□□□□ 0.79
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