RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	OPCML	Q14982	345 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		9.27	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	HELT	A6NFD8	242 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	HYPM	O75409	117 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	IFNA5	P01569	189 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	ORM2	P19652	201 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900		Q6ZRG5	221 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	TCF24	Q7RTU0	167 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	STPG3	Q8N7X2	389 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	GLMP	Q8WWB7	406 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	FBXL17	Q9UF56	701 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	RNF24	Q9Y225	148 aa		9.26	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	RNF222	A6NCQ9	220 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	OR4C46	A6NHA9	309 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	HMSD	A8MTL9	139 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	PAFAH1B2	P68402	229 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	GUCA2B	Q16661	112 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	MIC13	Q5XKP0	118 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	PRR25	Q96S07	402 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	ARL6	Q9H0F7	186 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	WFDC1	Q9HC57	220 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF98	A6NK75	572 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900		H3BRN7	92 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900		K7EIL1	84 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	B2M	P61769	119 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF266	Q14584	549 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	PATE2	Q6UY27	113 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900		Q8N1Y9	231 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF709	Q8N972	641 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	GPR82	Q96P67	336 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	PFDN5	Q99471	154 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	ARV1	Q9H2C2	271 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	SMLR1	H3BR10	107 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	TAAR5	O14804	337 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	ARPC5	O15511	151 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	OR5G3	P0C626	314 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF345	Q14585	488 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	MFF	Q9GZY8	342 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	DOK5	Q9P104	306 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	COX7A2P2	O60397	106 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	CD81	P60033	236 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	AKAP14	Q86UN6	197 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PKN1-208	ENST00000586900		A0A0D9SG52	128 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PKN1-208	ENST00000586900		A8MZ25	164 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PKN1-208	ENST00000586900		K7EQG2	157 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PKN1-208	ENST00000586900	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
PKN1-208	ENST00000586900	CD7	P09564	240 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PKN1-208	ENST00000586900	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
PKN1-208	ENST00000586900	GALR1	P47211	349 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PKN1-208	ENST00000586900	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PKN1-208	ENST00000586900	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PKN1-208	ENST00000586900	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PKN1-208	ENST00000586900	MRAP	Q8TCY5	172 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PKN1-208	ENST00000586900	DCANP1	Q8TF63	244 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PKN1-208	ENST00000586900	UHRF2	Q96PU4	802 aa		9.21	□□□□□ -0.94

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