RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561668.5

PKD1-223, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 3

Gene PKD1, Length 665 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-223	ENST00000561668	CXCL3	P19876	107 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	S100A11	P31949	105 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	CAV2	P51636	162 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	SELENOT	P62341	195 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	AKR1C1	Q04828	323 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	MPC2	O95563	127 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	BCAP31	P51572	246 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	CASC10	Q5T4H9	136 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668		Q6ZWC4	215 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	IL17D	Q8TAD2	202 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	CST7	O76096	145 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	ATP6V1F	Q16864	119 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PKD1-223	ENST00000561668	SPRY2	O43597	315 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	OR2F1	Q13607	317 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	FCN2	Q15485	313 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	STX12	Q86Y82	276 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	MED28	Q9H204	178 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	SMCO3	A2RU48	225 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	DEFB131A	P59861	70 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	HBG1	P69891	147 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	HBG2	P69892	147 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	BAX	Q07812	192 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	DCANP1	Q8TF63	244 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	CSTL1	Q9H114	145 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668		K7EQG2	157 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	AGPAT2	O15120	278 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	PET100	P0DJ07	73 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	LYZ	P61626	148 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	NHLH2	Q02577	135 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF124	Q15973	351 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	MGST2	Q99735	147 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	DEFB135	Q30KP9	77 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	LEMD1	Q68G75	181 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	STH	Q8IWL8	128 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00869	P0C866	280 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	S100A7	P31151	101 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF546	Q86UE3	836 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	FBXL17	Q9UF56	701 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF98	A6NK75	572 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	PRR20E	P86478	221 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	PRR20C	P86479	221 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	PRR20D	P86480	221 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	PRR20B	P86481	221 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	PRR20A	P86496	221 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	PATE2	Q6UY27	113 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	RNF183	Q96D59	192 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PKD1-223	ENST00000561668		H3BRN7	92 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	MPDU1	O75352	247 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF688	P0C7X2	276 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	RAB31	Q13636	194 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	NRN1	Q9NPD7	142 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	MBD2	Q9UBB5	411 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	HYPM	O75409	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	ORM2	P19652	201 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	CAMLG	P49069	296 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	OPCML	Q14982	345 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	C17orf77	Q96MU5	243 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKD1-223	ENST00000561668	GPR82	Q96P67	336 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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