RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	SLC25A22	Q9H936	323 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	DOK5	Q9P104	306 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059		U3KQE9	123 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059		E5RGE8	158 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	BUB3	O43684	328 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF688	P0C7X2	276 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	LINC00869	P0C866	280 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	SULT1A1	P50225	295 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	RAB31	Q13636	194 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	NRN1	Q9NPD7	142 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	ALG5	Q9Y673	324 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059		K7EQG2	157 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	OR5G3	P0C626	314 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	S100A11	P31949	105 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	BAX	Q07812	192 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	ARL16	Q0P5N6	197 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	RGS21	Q2M5E4	152 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	LEMD1	Q68G75	181 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	STH	Q8IWL8	128 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	CITED4	Q96RK1	184 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	SORL1	Q92673	2214 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CHID1-222	ENST00000533059	IGSF23	A1L1A6	192 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	HYPM	O75409	117 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	GALR1	P47211	349 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	IL15RA	Q13261	267 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	STPG3	Q8N7X2	389 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	RETN	Q9HD89	108 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	RNF24	Q9Y225	148 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	AGPAT2	O15120	278 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	ID1	P41134	155 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	H2BFS	P57053	126 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF124	Q15973	351 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	ATP6V1F	Q16864	119 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	PSMG4	Q5JS54	123 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	DCANP1	Q8TF63	244 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	ARL6	Q9H0F7	186 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	MED28	Q9H204	178 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF98	A6NK75	572 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	UBE2C	O00762	179 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	COX7A2P2	O60397	106 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	CAMLG	P49069	296 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	GPR82	Q96P67	336 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059		H3BRN7	92 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	FGF7	P21781	194 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	MEOX2	P50222	304 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	FGL1	Q08830	312 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059		Q6ZRG5	221 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	MGST2	Q99735	147 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	ARV1	Q9H2C2	271 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	MPC2	O95563	127 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	PLP1	P60201	277 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	CLINT1	Q14677	625 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	DEFB135	Q30KP9	77 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	THAP6	Q8TBB0	222 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	C16orf92	Q96LL3	132 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	UHRF2	Q96PU4	802 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	CSTL1	Q9H114	145 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	KNCN	A6PVL3	124 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	MPDU1	O75352	247 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	PSMB3	P49720	205 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	B2M	P61769	119 aa		10.22	□□□□□ -0.77

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