RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 LEMD1Q68G75 181 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 DNAH7Q8WXX0 4024 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF688P0C7X2 276 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 ORM2P19652 201 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 PLP1P60201 277 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC38A11Q08AI6 406 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 VWC2Q2TAL6 325 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 TEPPQ6URK8 271 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 PATE2Q6UY27 113 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 MGST2Q99735 147 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 RNF126Q9BV68 326 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 EDA2RQ9HAV5 297 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 NRN1Q9NPD7 142 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 OR5AC2Q9NZP5 309 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC45A2Q9UMX9 530 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF98A6NK75 572 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SSNA1O43805 119 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SULT1A1P50225 295 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SELENOTP62341 195 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 KIR2DL5AQ8N109 375 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 OR1B1Q8NGR6 318 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 DOK5Q9P104 306 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 ALG5Q9Y673 324 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SOCS3O14543 225 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 AGPAT2O15120 278 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00869P0C866 280 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC25A32Q9H2D1 315 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 KNCNA6PVL3 124 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 H3BRN7 92 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 HYPMO75409 117 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 CXCL3P19876 107 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 S100A11P31949 105 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 APOC4P55056 127 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 NHLH2Q02577 135 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 Q6ZWC4 215 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 OR8I2Q8N0Y5 310 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SCRT1Q9BWW7 348 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 CSTL1Q9H114 145 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 FBXL17Q9UF56 701 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 E5RGE8 158 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 UBE2CO00762 179 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 PSMG4Q5JS54 123 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 UHRF2Q96PU4 802 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 ARL6Q9H0F7 186 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC25A22Q9H936 323 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-225ENST00000513069 MPC2O95563 127 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 RLN2P04090 185 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 PRR20EP86478 221 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 PRR20CP86479 221 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 PRR20DP86480 221 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 PRR20BP86481 221 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 PRR20AP86496 221 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 DEFB135Q30KP9 77 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF546Q86UE3 836 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 STX12Q86Y82 276 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM37Q8WXS4 190 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 RNF183Q96D59 192 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 RSG1Q9BU20 258 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 HIGD1AQ9Y241 93 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 SPRY2O43597 315 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 OR5G3P0C626 314 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 CAMLGP49069 296 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 DEFB1P60022 68 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 HBG1P69891 147 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 HBG2P69892 147 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 ATP6V1FQ16864 119 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 MORN5Q5VZ52 161 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 MIC13Q5XKP0 118 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 OR11H7Q8NGC8 314 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-225ENST00000513069 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms