RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 LYZP61626 148 aa11.66□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF90Q03938 601 aa11.66□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 OR8I2Q8N0Y5 310 aa11.66□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 OR51S1Q8NGJ8 323 aa11.66□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 SMIM4Q8WVI0 70 aa11.66□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.66□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 RBKSQ9H477 322 aa11.66□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 PRR13Q9NZ81 148 aa11.66□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.66□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 TNFSF8P32971 234 aa11.65□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 GAMTQ14353 236 aa11.65□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 OXA1LQ15070 435 aa11.65□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF79Q15937 498 aa11.65□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 RNF212Q495C1 297 aa11.65□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.65□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF709Q8N972 641 aa11.65□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 DIRAS2Q96HU8 199 aa11.65□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 SOSTQ9BQB4 213 aa11.65□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 SLC35B3Q9H1N7 401 aa11.65□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.65□□□□□ -0.54
ITGA3-211ENST00000508100 A0A0B4J2A0 478 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 ISLRO14498 428 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 OR2F1Q13607 317 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 IL18Q14116 193 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 RRN3P1Q2M238 152 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 FAM78BQ5VT40 261 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 Q6ZR54 194 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 OR1S1Q8NH92 325 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 RPRMQ9NS64 109 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 F6UB75 175 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 SOCS3O14543 225 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 CTDSPLO15194 276 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 ANXA3P12429 323 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 AKR1C4P17516 323 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 S100A5P33763 92 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 PAX9P55771 341 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 DAD1P61803 113 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 SRPXP78539 464 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC190Q86UF4 302 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM208Q9BTX3 173 aa11.63□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.62□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 MEOX2P50222 304 aa11.62□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 RAB11AP62491 216 aa11.62□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 CNPY1Q3B7I2 92 aa11.62□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.62□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 C16orf92Q96LL3 132 aa11.62□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 TRGV9Q99603 122 aa11.62□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 MCUBQ9NWR8 336 aa11.62□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.62□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 V9GYH0 126 aa11.62□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 A0A0J9YX75 114 aa11.61□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 GALR1P47211 349 aa11.61□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.61□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 GSG1LQ6UXU4 331 aa11.61□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 DOK5Q9P104 306 aa11.61□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.6□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 FABP12A6NFH5 140 aa11.6□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.6□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00299Q6ZSB3 139 aa11.6□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 ATG101Q9BSB4 218 aa11.6□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 SLC25A22Q9H936 323 aa11.6□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.6□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 S100A7P31151 101 aa11.59□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF575Q86XF7 245 aa11.59□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.59□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.59□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 RSG1Q9BU20 258 aa11.59□□□□□ -0.55
ITGA3-211ENST00000508100 FAT2Q9NYQ8 4349 aa11.58□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.58□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 IAPPP10997 89 aa11.58□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.58□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 C20orf173Q96LM9 149 aa11.58□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 SLC25A32Q9H2D1 315 aa11.58□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 DNAH2Q9P225 4427 aa11.57□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.57□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 MED6O75586 246 aa11.57□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 THAP8Q8NA92 274 aa11.57□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 OR1B1Q8NGR6 318 aa11.57□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 SLC45A2Q9UMX9 530 aa11.57□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 NACAE9PAV3 2078 aa11.56□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 PKHD1P08F94 4074 aa11.56□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa11.56□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF98A6NK75 572 aa11.56□□□□□ -0.56
ITGA3-211ENST00000508100 LYRM9A8MSI8 78 aa11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms