RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477109.1

KDM5C-211, Transcript of lysine demethylase 5C, humanhuman

TSL 3

Gene KDM5C, Length 297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5C-211ENST00000477109 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 MLXQ9UH92 298 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 RABAC1Q9UI14 185 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 U3KQE9 123 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 HMSDA8MTL9 139 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 LYZP61626 148 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 OR2F1Q13607 317 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 CLINT1Q14677 625 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 MGST2Q99735 147 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 RNF24Q9Y225 148 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 TSPAN4O14817 238 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 BUB3O43684 328 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 IFNA5P01569 189 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 LINC00869P0C866 280 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 EDN2P20800 178 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 FGF7P21781 194 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 ZNF266Q14584 549 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 OPCMLQ14982 345 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 Q6ZRG5 221 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 Q8N1Y9 231 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 ST8SIA2Q92186 375 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 NEURL2Q9BR09 285 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 RNF222A6NCQ9 220 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 HELTA6NFD8 242 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 HYPMO75409 117 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 PRR20EP86478 221 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 PRR20CP86479 221 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 PRR20DP86480 221 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 PRR20BP86481 221 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 PRR20AP86496 221 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 ZNF345Q14585 488 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 STPG3Q8N7X2 389 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 ZNF709Q8N972 641 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 RNF2Q99496 336 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 FBXL17Q9UF56 701 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 TAAR5O14804 337 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 ORM2P19652 201 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 B2MP61769 119 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 PAFAH1B2P68402 229 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 AKAP14Q86UN6 197 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 GLMPQ8WWB7 406 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 GPR82Q96P67 336 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 PFDN5Q99471 154 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 OR4C46A6NHA9 309 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 ZNF785A8K8V0 405 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 A8MZ25 164 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 ARPC5O15511 151 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 MIC13Q5XKP0 118 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 TCF24Q7RTU0 167 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 MFFQ9GZY8 342 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 ARL6Q9H0F7 186 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 ARV1Q9H2C2 271 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5C-211ENST00000477109 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.6 ms