RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 SPSB1Q96BD6 273 aa6.02□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.02□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 C12orf77C9JDV5 145 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 OVOL1O14753 267 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SH2D1BO14796 132 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF20P17024 532 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ATP6V0CP27449 155 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 Q0VG73 95 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 FOXE3Q13461 319 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 PIGYQ3MUY2 71 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 OR11H1Q8NG94 326 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 PP6455Q8WZ26 134 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 NABP2Q9BQ15 211 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 KLK15Q9H2R5 256 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 HSF4Q9ULV5 492 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.01□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 A0A1B0GV72 72 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 G3V318 75 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 IFNA5P01569 189 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 PSMB8P28062 276 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 CTRLP40313 264 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 PRRX1P54821 245 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SLURP1P55000 103 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TCTAP57738 103 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 EBI3Q14213 229 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 PRR27Q6MZM9 219 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 C19orf35Q6ZS72 473 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 MOB3BQ86TA1 216 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 GVQW1Q8N7I0 195 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 OR4S2Q8NH73 311 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 GPR146Q96CH1 333 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 RNF183Q96D59 192 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 OR4C12Q96R67 309 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ATP5SQ99766 215 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 FAM110AQ9BQ89 295 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SMIM3Q9BZL3 60 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 CST9LQ9H4G1 147 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 BANF2Q9H503 90 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 C11orf1Q9H5F2 150 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 NAA60Q9H7X0 242 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 LINC00574Q9H8X3 128 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 MANBALQ9NQG1 85 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 EHFQ9NZC4 300 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SMPXQ9UHP9 88 aa6□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 DEGS1O15121 323 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ATP6V0E1O15342 81 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 NDUFB8O95169 186 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 CNIH1O95406 144 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 BRI3O95415 125 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 KRASP01116 189 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 IGHG4P01861 327 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ELANEP08246 267 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SMIM17P0DL12 118 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 IGLC2P0DOY2 106 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 IGLC3P0DOY3 106 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SLC25A6P12236 298 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 GNB3P16520 340 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 CCL20P78556 96 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 NDPQ00604 133 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 UNC119Q13432 240 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM187Q14656 261 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ARPC1AQ92747 370 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 IL22RA2Q969J5 263 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 S1PR3Q99500 378 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TXN2Q99757 166 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 LPAR5Q9H1C0 372 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SZRD1-208ENST00000476423 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms