RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 AP3S1Q92572 193 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 B3GALNT1O75752 331 aa7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 ID1P41134 155 aa7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SMCO1Q147U7 214 aa7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 AMTNQ6UX39 209 aa7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 RNF182Q8N6D2 247 aa7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 RSG1Q9BU20 258 aa7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A22Q9H936 323 aa7.9□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 AKAIN1P0CW23 69 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 DEFB130BP0DP73 79 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 DEFB130AP0DP74 79 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 AZU1P20160 251 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 RRN3P1Q2M238 152 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 BAP18Q8IXM2 172 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 OR1S1Q8NH92 325 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 SLC35E1Q96K37 410 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 C16orf92Q96LL3 132 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 U3KQ87 197 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 C16orf90A8MZG2 172 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 ISLRO14498 428 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 CCR6P51684 374 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 PAX9P55771 341 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 IL18Q14116 193 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 RNF212Q495C1 297 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 FAM210BQ96KR6 192 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 MCUBQ9NWR8 336 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 DOK5Q9P104 306 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 A0A0B4J2A0 478 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 NUDT3O95989 172 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 ORM2P19652 201 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 NOXA1Q86UR1 476 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 IL22RA2Q969J5 263 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 ATG101Q9BSB4 218 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 RPRMQ9NS64 109 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.87□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 ZNF98A6NK75 572 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 F5H768 121 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 FGL1Q08830 312 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 OXA1LQ15070 435 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 TRGV9Q99603 122 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 PRRT1Q99946 306 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.86□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 A8MTW9 85 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 H3BP45 60 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 PITX3O75364 302 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 HTN1P15515 57 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 THAP8Q8NA92 274 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 UHRF2Q96PU4 802 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 PRSS46E5RG02 174 aa7.84□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 WRBO00258 174 aa7.84□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 INSP01308 110 aa7.84□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 GALR1P47211 349 aa7.84□□□□□ -1.15
ACTB-209ENST00000473257 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
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