RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 A0A1W2PPV4 95 aa18.6■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 NDUFA4O00483 81 aa18.6■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 H2AFB1P0C5Y9 115 aa18.6■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa18.6■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 MIR17HGQ75NE6 70 aa18.6■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 LINC00305Q7Z4B0 112 aa18.6■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 FUT9Q9Y231 359 aa18.6■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 HIGD1AQ9Y241 93 aa18.6■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa18.59■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 A0A1W2PRX2 142 aa18.59■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 NUDT19A8MXV4 375 aa18.58■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 LCN15Q6UWW0 184 aa18.58■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 C8orf86Q6ZUL3 223 aa18.58■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 SFT2D1Q8WV19 159 aa18.58■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 MBD3L1Q8WWY6 194 aa18.58■□□□□ 0.57
NME4-209ENST00000460297 RPEL1Q2QD12 228 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 AWAT1Q58HT5 328 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 GPHB5Q86YW7 130 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 LYPD6BQ8NI32 183 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 RNF2Q99496 336 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 TRAV5A0A0B4J249 113 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 A0A1B0GV50 99 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 OR11H1Q8NG94 326 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 DUX3Q96PT4 197 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 C20orf24Q9BUV8 137 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 HRH4Q9H3N8 390 aa18.57■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 TMEM190Q8WZ59 177 aa18.56■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 STAG3L2P0CL84 134 aa18.55■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 STAG3L3P0CL85 134 aa18.55■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 LEMD1Q68G75 181 aa18.55■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 SCRT1Q9BWW7 348 aa18.55■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 RABAC1Q9UI14 185 aa18.55■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 ZNF320A2RRD8 509 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 LINC01619G3V211 115 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 H3BRN7 92 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 OR1N2Q8NGR9 330 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 TEX46H3BTG2 121 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 C8orf88P0DMB2 117 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 CCL20P78556 96 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 FAM106AQ4KMX7 169 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 RAX2Q96IS3 184 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 SLC25A2Q9BXI2 301 aa18.54■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 ARL14EPLP0DKL9 152 aa18.53■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 ZP3P21754 424 aa18.53■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 SLURP1P55000 103 aa18.53■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 ZNF503Q96F45 646 aa18.53■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 CRYBB3P26998 211 aa18.52■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 DPF1Q92782 380 aa18.52■□□□□ 0.56
NME4-209ENST00000460297 ZNF98A6NK75 572 aa18.51■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 APOHP02749 345 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 SYNJ2BPP57105 145 aa18.51■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 METTL26Q96S19 204 aa18.51■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa18.51■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 HBE1P02100 147 aa18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 NPPCP23582 126 aa18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 TAS2R45P59539 299 aa18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 FHL3Q13643 280 aa18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 TM4SF20Q53R12 229 aa18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 KHDC3LQ587J8 217 aa18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 NDUFA11Q86Y39 141 aa18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 U3KQE9 123 aa18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 CCL24O00175 119 aa18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 CXorf1O96002 111 aa18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 REC114Q7Z4M0 266 aa18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa18.49■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa18.49■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa18.49■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 LGALS9O00182 355 aa18.49■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 OR7C2O60412 319 aa18.49■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 S100A7AQ86SG5 101 aa18.49■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 C1QL4Q86Z23 238 aa18.49■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 CITED1Q99966 193 aa18.49■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 WNK1Q9H4A3 2382 aa18.48■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 K7EMT4 169 aa18.48■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 BUB3O43684 328 aa18.48■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 PYYP10082 97 aa18.48■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 EDN2P20800 178 aa18.48■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 PQLC2Q6ZP29 291 aa18.48■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa18.47■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 A8MWP6 167 aa18.47■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 GCHFRP30047 84 aa18.47■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 IL34Q6ZMJ4 242 aa18.47■□□□□ 0.55
NME4-209ENST00000460297 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms