RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.76□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 SMPXQ9UHP9 88 aa7.76□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.76□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 U3KQE9 123 aa7.76□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 CHEK1O14757 476 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 SAP30O75446 220 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 ORM2P19652 201 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 PATE2Q6UY27 113 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 TMUB2Q71RG4 321 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 RNF141Q8WVD5 230 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 METTL26Q96S19 204 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 VSIRQ9H7M9 311 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 DOK5Q9P104 306 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 MLXQ9UH92 298 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 RABAC1Q9UI14 185 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 RFNGQ9Y644 331 aa7.75□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 BCL2L11O43521 198 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 HYPMO75409 117 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV1-51P01701 117 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 NPPCP23582 126 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 INSL3P51460 131 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 B2MP61769 119 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 ST8SIA2Q92186 375 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 ARL6Q9H0F7 186 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 ARV1Q9H2C2 271 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.74□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 G3V4G9 280 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 H3BRN7 92 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 PFDN1O60925 122 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 JTBO76095 146 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 ATP6V0CP27449 155 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF709Q8N972 641 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 RNF2Q99496 336 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.73□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PS18 150 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 BUB3O43684 328 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 COX7A2P2O60397 106 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 OR5G3P0C626 314 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 Q6ZRG5 221 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 GLMPQ8WWB7 406 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 UHRF2Q96PU4 802 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 PFDN5Q99471 154 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 DNHD1Q96M86 4753 aa7.72□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.71□□□□□ -1.17
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF98A6NK75 572 aa7.71□□□□□ -1.18
GARNL3-211ENST00000460176 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.71□□□□□ -1.18
GARNL3-211ENST00000460176 BMI1P35226 326 aa7.71□□□□□ -1.18
GARNL3-211ENST00000460176 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.71□□□□□ -1.18
GARNL3-211ENST00000460176 MORN5Q5VZ52 161 aa7.71□□□□□ -1.18
GARNL3-211ENST00000460176 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.71□□□□□ -1.18
GARNL3-211ENST00000460176 LEMD1Q68G75 181 aa7.71□□□□□ -1.18
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.71□□□□□ -1.18
GARNL3-211ENST00000460176 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.71□□□□□ -1.18
GARNL3-211ENST00000460176 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms