RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 SLC35E1Q96K37 410 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 RBKSQ9H477 322 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 DKK2Q9UBU2 259 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 GPR132Q9UNW8 380 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 V9GYH0 126 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 HSPG2P98160 4391 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 SOCS3O14543 225 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
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GARNL3-210ENST00000453030 ZNF79Q15937 498 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.31□□□□□ -1.08
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GARNL3-210ENST00000453030 IL22RA2Q969J5 263 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 PRRT1Q99946 306 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 U3KQ87 197 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 HBE1P02100 147 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 CCR6P51684 374 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 PSG9Q00887 426 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 GAMTQ14353 236 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 FAM78BQ5VT40 261 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 FAM210BQ96KR6 192 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 SOSTQ9BQB4 213 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 SRRQ9GZT4 340 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 MCUBQ9NWR8 336 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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GARNL3-210ENST00000453030 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 A0A0B4J2A0 478 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 ISLRO14498 428 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 IAPPP10997 89 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 AKR1C4P17516 323 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 Q6ZR54 194 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 OR1S1Q8NH92 325 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 C20orf173Q96LM9 149 aa8.29□□□□□ -1.08
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GARNL3-210ENST00000453030 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.28□□□□□ -1.08
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GARNL3-210ENST00000453030 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 PAX9P55771 341 aa8.28□□□□□ -1.08
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GARNL3-210ENST00000453030 RRN3P1Q2M238 152 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 C16orf92Q96LL3 132 aa8.28□□□□□ -1.08
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GARNL3-210ENST00000453030 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.28□□□□□ -1.08
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GARNL3-210ENST00000453030 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-210ENST00000453030 SLC25A22Q9H936 323 aa8.28□□□□□ -1.08
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GARNL3-210ENST00000453030 ANXA3P12429 323 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 IFITM3Q01628 133 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 TRIQKQ629K1 86 aa8.27□□□□□ -1.09
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GARNL3-210ENST00000453030 DOK5Q9P104 306 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 M0R2Z0 102 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 UPK1BO75841 260 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 IL7P13232 177 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 GALR1P47211 349 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 INPP1P49441 399 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 MEOX2P50222 304 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 RAB11AP62491 216 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 SRPXP78539 464 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 OXA1LQ15070 435 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-210ENST00000453030 RNF212Q495C1 297 aa8.26□□□□□ -1.09
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