RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 PSG11Q9UQ72 335 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 HCFC1P51610 2035 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 PMS2CLQ68D20 193 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 MBD6Q96DN6 1003 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 NKX2-8O15522 239 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FCGR3BO75015 233 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 CCL11P51671 97 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 MLANAQ16655 118 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF503Q96F45 646 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 VSTM5A8MXK1 200 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 GRPP07492 148 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 CYC1P08574 325 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 COX19Q49B96 90 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 MORN5Q5VZ52 161 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 OR2H2O95918 312 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 PLAUP00749 431 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM106CPP0CH98 169 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 GNG3P63215 75 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 DEFB124Q8NES8 71 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 RNF183Q96D59 192 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 C20orf78Q9BR46 151 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 LRRK2Q5S007 2527 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 H3BTX0 84 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-48P01763 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 P0C879 139 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 PYYP10082 97 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 AREGP15514 252 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 ASCL2Q99929 193 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 ZANQ9Y493 2812 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 A1L4Q6 167 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 H3BMG7 143 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 OR5AL1P0C617 328 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FGF6P10767 208 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FXYD2P54710 66 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 OR4A16Q8NH70 328 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 OR2V2Q96R30 315 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 NABP2Q9BQ15 211 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM17P0DL12 118 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 SCGB1A1P11684 91 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 ACP1P24666 158 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 CATR1Q13166 79 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 TEPPQ6URK8 271 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 MRAP2Q96G30 205 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-211ENST00000618610 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms