RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF79	Q15937	498 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	VAMP1	P23763	118 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	PRR20E	P86478	221 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	PRR20C	P86479	221 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	PRR20D	P86480	221 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	PRR20B	P86481	221 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	PRR20A	P86496	221 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	CCDC190	Q86UF4	302 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	DCANP1	Q8TF63	244 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	PITX3	O75364	302 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF688	P0C7X2	276 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	PSG1	P11464	419 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	SLC25A6	P12236	298 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	DHRS2	Q13268	280 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	LRTM2	Q8N967	370 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	GLMP	Q8WWB7	406 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	SLC35E1	Q96K37	410 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	ZFP92	A6NM28	416 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	BUB3	O43684	328 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	MED6	O75586	246 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	SFT2D2	O95562	160 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	SPP1	P10451	314 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	INPP1	P49441	399 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	RAB11A	P62491	216 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PSME3-215	ENST00000592578	PKHD1	P08F94	4074 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578		A0A1B0GVY2	172 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	IGLL5	B9A064	214 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	C11orf94	C9JXX5	98 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	FABP1	P07148	127 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	PPP1R1A	Q13522	171 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	GAMT	Q14353	236 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	RNF125	Q96EQ8	232 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	NRN1	Q9NPD7	142 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	KNCN	A6PVL3	124 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	IAPP	P10997	89 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	PSMG4	Q5JS54	123 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	SRR	Q9GZT4	340 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	SYNGR2	O43760	224 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	HOXB5	P09067	269 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF90	Q03938	601 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	TRIQK	Q629K1	86 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	RAB40C	Q96S21	281 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	TRGV9	Q99603	122 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	WRB	O00258	174 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	DEFB4A	O15263	64 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	LYZ	P61626	148 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	BAK1	Q16611	211 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	C9orf170	A2RU37	121 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	CENPX	A8MT69	81 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	NDUFB6	O95139	128 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	MIF	P14174	115 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	C4BPB	P20851	252 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	OR2F1	Q13607	317 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	COQ8A	Q8NI60	647 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PSME3-215	ENST00000592578	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.34	□□□□□ -0.75

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