RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 MYO9BQ13459 2157 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-11P01762 117 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 PLNP26678 52 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 CT83Q5H943 113 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00614P0C842 121 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 SRD5A1P18405 259 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 C5orf30Q96GV9 206 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 VCYO14598 125 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 TCRAP04437 139 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 E9PQ18 207 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV1-44P01699 117 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 Q5BKY6 102 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 RCHY1Q96PM5 261 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 SCN5AQ14524 2016 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 SAP30O75446 220 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 APOMO95445 188 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 CD33P20138 364 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV3-20P01619 116 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV1-69P01742 117 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGKCP01834 107 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 MLNRO43193 412 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 CD28P10747 220 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 COQ2Q96H96 371 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 E7EQL1 145 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 LINC01619G3V211 115 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 PSG1P11464 419 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 U3KQA8 63 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 EGR1P18146 543 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 MGST2Q99735 147 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 H3BUX3 64 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 KLK15Q9H2R5 256 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 SLC17A3O00476 420 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 TTC32Q5I0X7 151 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 J3QKU1 62 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 PSPNO60542 156 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 WFDC1Q9HC57 220 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1-5P01602 117 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 TCF21O43680 179 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 H0YIZ8 118 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 ELANEP08246 267 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 H7C2G1 150 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-48P01763 117 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 ADMP35318 185 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 GNG5P63218 68 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 RMI2Q96E14 147 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 APOC4P55056 127 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 HGFACQ04756 655 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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