RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 IL4P05112 153 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 C8orf88P0DMB2 117 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 FOLR2P14207 255 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 CBLN1P23435 193 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 S100A7P31151 101 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF90Q03938 601 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 Q5BKY6 102 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 DYNLRB2Q8TF09 96 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 RNF125Q96EQ8 232 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 DNHD1Q96M86 4753 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 MGAM2Q2M2H8 2515 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 G3V3Q6 166 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 TM4SF20Q53R12 229 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 AKAP14Q86UN6 197 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM231Q9H6L2 316 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PS18 150 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 IGLV1-51P01701 117 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 CLINT1Q14677 625 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 S100A7AQ86SG5 101 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-218ENST00000525459 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 AGPAT2O15120 278 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 CD5P06127 495 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 NPPCP23582 126 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 CAMLGP49069 296 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF266Q14584 549 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 BTNL8Q6UX41 500 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 RABAC1Q9UI14 185 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 IFNA5P01569 189 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 CRYBB3P26998 211 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 RNF222A6NCQ9 220 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 HMSDA8MTL9 139 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.19□□□□□ -0.142e-7■■□□□ 11.7
PTPRK-218ENST00000525459 FGF7P21781 194 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF345Q14585 488 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 LCN12Q6JVE5 192 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 MGST2Q99735 147 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 SMPXQ9UHP9 88 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 ARPC5O15511 151 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 LINC00869P0C866 280 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 PLP1P60201 277 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 LYZP61626 148 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 OR2F1Q13607 317 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 FBXL17Q9UF56 701 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 RNF24Q9Y225 148 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 G3V4G9 280 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 OPCMLQ14982 345 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 VSIRQ9H7M9 311 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.17□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.17□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF709Q8N972 641 aa14.17□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 SCGB1C1Q8TD33 95 aa14.17□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa14.17□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.17□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 MFFQ9GZY8 342 aa14.17□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 SMLR1H3BR10 107 aa14.16□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 CHEK1O14757 476 aa14.16□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 TAAR5O14804 337 aa14.16□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 DEFB114Q30KQ6 69 aa14.16□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 Q6ZRG5 221 aa14.16□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 MLXQ9UH92 298 aa14.16□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 SORL1Q92673 2214 aa14.16□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1B0GVG6 124 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 PRR20EP86478 221 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 PRR20CP86479 221 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 PRR20DP86480 221 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 PRR20BP86481 221 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 PRR20AP86496 221 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 U3KQE9 123 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRK-218ENST00000525459 C1QBP02746 253 aa14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms