RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 TEPPQ6URK8 271 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 TMUB2Q71RG4 321 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 OR11H1Q8NG94 326 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 S4R3C0 116 aa8.7□□□□□ -1.02
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UBE2B-208ENST00000511807 BCL2L11O43521 198 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 OR10J1P30954 320 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 ARL3P36405 182 aa8.69□□□□□ -1.02
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UBE2B-208ENST00000511807 ZNF709Q8N972 641 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 THAP8Q8NA92 274 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC140Q96MF4 163 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 OR5B12Q96R08 314 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.69□□□□□ -1.02
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UBE2B-208ENST00000511807 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.68□□□□□ -1.02
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UBE2B-208ENST00000511807 TGOLN2O43493 480 aa8.68□□□□□ -1.02
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UBE2B-208ENST00000511807 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 SELENOTP62341 195 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 FHL3Q13643 280 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 BTNL8Q6UX41 500 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 TRGV9Q99603 122 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 GNB4Q9HAV0 340 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 WFDC1Q9HC57 220 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 I3L521 148 aa8.67□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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UBE2B-208ENST00000511807 CAMLGP49069 296 aa8.67□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF616Q08AN1 781 aa8.67□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 OPCMLQ14982 345 aa8.67□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.67□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 Q8WTZ3 238 aa8.67□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.67□□□□□ -1.02
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UBE2B-208ENST00000511807 SLC51BQ86UW2 128 aa8.66□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.66□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.66□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 COL7A1Q02388 2944 aa8.66□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 TENM3Q9P273 2699 aa8.65□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.65□□□□□ -1.02
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UBE2B-208ENST00000511807 PPP5D1E7EU14 171 aa8.65□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 LINC01619G3V211 115 aa8.65□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 BMPR1BO00238 502 aa8.65□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 SAP30O75446 220 aa8.65□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 OR2C1O95371 312 aa8.65□□□□□ -1.02
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UBE2B-208ENST00000511807 ADMP35318 185 aa8.65□□□□□ -1.02
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UBE2B-208ENST00000511807 INSL3P51460 131 aa8.65□□□□□ -1.02
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UBE2B-208ENST00000511807 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.65□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.65□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 MGST2Q99735 147 aa8.65□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.65□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.65□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.65□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.65□□□□□ -1.02
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.64□□□□□ -1.03
UBE2B-208ENST00000511807 A0A087WW49 117 aa8.64□□□□□ -1.03
UBE2B-208ENST00000511807 C3orf84H3BNL1 204 aa8.64□□□□□ -1.03
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFA4O00483 81 aa8.64□□□□□ -1.03
UBE2B-208ENST00000511807 OVOL1O14753 267 aa8.64□□□□□ -1.03
UBE2B-208ENST00000511807 YIF1AO95070 293 aa8.64□□□□□ -1.03
UBE2B-208ENST00000511807 TRBV12-3P01733 135 aa8.64□□□□□ -1.03
UBE2B-208ENST00000511807 PSG1P11464 419 aa8.64□□□□□ -1.03
UBE2B-208ENST00000511807 S100A7P31151 101 aa8.64□□□□□ -1.03
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF90Q03938 601 aa8.64□□□□□ -1.03
UBE2B-208ENST00000511807 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.64□□□□□ -1.03
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