RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF138	P52744	262 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	PPBP	P02775	128 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	EMP1	P54849	157 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	SFTA2	Q6UW10	78 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	LYPD6	Q86Y78	171 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	DEFB124	Q8NES8	71 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	NDUFA3	O95167	84 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	GAGE13	Q4V321	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	IGLL1	P15814	213 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	LINC00479	Q96M42	142 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	PAX2	Q02962	417 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	PRR7	Q8TB68	274 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574		S4R3C0	116 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	NKX2-8	O15522	239 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	LOXL3	P58215	753 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	CCL3L1	P16619	93 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	RPRML	Q8N4K4	120 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-222	ENST00000496574	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	PINLYP	A6NC86	204 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	TCRA	P04437	139 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	HTN1	P15515	57 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574		V9GYV3	84 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	IGKC	P01834	107 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	PDLIM4	P50479	330 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	SRRM5	B3KS81	715 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574		M0R381	172 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574		D6R8Y8	96 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	TGFA	P01135	160 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	METRN	Q9UJH8	293 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	FAM231B	A6NCW3	169 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	MYOD1	P15172	320 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	MLNR	O43193	412 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	IGLV3-1	P01715	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	FNDC10	F2Z333	226 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	SLA	Q13239	276 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	TEX29	Q8N6K0	151 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	RNF125	Q96EQ8	232 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	PLXNA2	O75051	1894 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	SMPX	Q9UHP9	88 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	FAM106CP	P0CH98	169 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	NPPC	P23582	126 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	ADIPOQ	Q15848	244 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	PPP1R17	O96001	155 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	ID1	P41134	155 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	CKS1B	P61024	79 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	IL18BP	O95998	194 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574		F2Z2F3	143 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	CDKN1B	P46527	198 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	MLANA	Q16655	118 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	CD177	Q8N6Q3	437 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	RCHY1	Q96PM5	261 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PKD1-222	ENST00000496574	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55

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