RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD81P60033 236 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM219Q86XT9 240 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR5T1Q8NG75 326 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 USMG5Q96IX5 58 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 FUT9Q9Y231 359 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.252e-6■■■■□ 24
CCNDBP1-202ENST00000444658 AKAP9Q99996 3911 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC01548A6NM66 108 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 F6UZH7 168 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV1-17P01599 117 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV4-59P01825 116 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 MT-ND4LP03901 98 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 APELAP0DMC3 54 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 TAS2R45P59539 299 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM209BQ5JX69 171 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF24Q9Y225 148 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 COLCA2A8K830 154 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFB8O95169 186 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR2C1O95371 312 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 TOMM40O96008 361 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV1-40P01703 118 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 RD3LP0DJH9 198 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 C8orf88P0DMB2 117 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 FOSL1P15407 271 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 HNF1AP20823 631 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 S100A7P31151 101 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 BLCAPP62952 87 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF90Q03938 601 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 LY6EQ16553 131 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM78BQ5VT40 261 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8N2B8 174 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 NAT8Q9UHE5 227 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF727A8MUV8 499 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 C11orf94C9JXX5 98 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 F8W735 103 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLDN34H7C241 214 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 PAGE4O60829 102 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 HYPMO75409 117 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 CTSGP08311 255 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSG1P11464 419 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 GCHFRP30047 84 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 CFHR3Q02985 330 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 LCE2CQ5TA81 110 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 PATE2Q6UY27 113 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8WTZ3 238 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 DOK5Q9P104 306 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0G2JLM5 398 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 G3V318 75 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 WIPF1O43516 503 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 GNG7O60262 68 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX7A2P2O60397 106 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR2J3O76001 311 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 RHOGP84095 191 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP5G2Q06055 141 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 ECSCRQ19T08 205 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 C15orf32Q32M92 178 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 457.4 ms