RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		12.92	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A6	P12236	298 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	OR1S1	Q8NH92	325 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	KNCN	A6PVL3	124 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNA4	P05014	189 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	SPP1	P10451	314 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	S100A5	P33763	92 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	DHRS2	Q13268	280 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	GAMT	Q14353	236 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	RYR1	P21817	5038 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC160	A6NGH7	325 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	SFT2D2	O95562	160 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	C4BPB	P20851	252 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738		Q8NAQ8	132 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF125	Q96EQ8	232 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	VAMP1	P23763	118 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R1A	Q13522	171 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB40C	Q96S21	281 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	SRR	Q9GZT4	340 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	MFF	Q9GZY8	342 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	NRN1	Q9NPD7	142 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF90	Q03938	601 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMG4	Q5JS54	123 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC35E1	Q96K37	410 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFP92	A6NM28	416 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB4A	O15263	64 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	IAPP	P10997	89 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB11A	P62491	216 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738		X6R8D5	127 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	PRSS46	E5RG02	174 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	MED6	O75586	246 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	THAP8	Q8NA92	274 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	TRGV9	Q99603	122 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	HRH4	Q9H3N8	390 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	SYNGR2	O43760	224 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	MIF	P14174	115 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	BAK1	Q16611	211 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BMM0	161 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	FABP1	P07148	127 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXB5	P09067	269 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXL17	Q9UF56	701 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	C9orf170	A2RU37	121 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	WRB	O00258	174 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	SOCS3	O14543	225 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	HLA-DRB4	P13762	266 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	LYZ	P61626	148 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR20E	P86478	221 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR20C	P86479	221 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR20D	P86480	221 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR20B	P86481	221 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR20A	P86496	221 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFB6	O95139	128 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	TCTA	P57738	103 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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