RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 TAS2R45P59539 299 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 KCNS1Q96KK3 526 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 SLAQ13239 276 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 NIT1Q86X76 327 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 DDB2Q92466 427 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 ADTRPQ96IZ2 230 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 PPIAL4EA0A075B759 164 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 PPIAL4DF5H284 164 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 BMPR1BO00238 502 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 PPIAL4FP0DN26 164 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF137PP52743 207 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF841Q6ZN19 808 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 GGTLC3B5MD39 225 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 OR52E5Q8NH55 327 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 SVEP1Q4LDE5 3571 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 RPL24P83731 157 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM200BQ69YZ2 307 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 OR1L8Q8NGR8 309 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 TSKUQ8WUA8 353 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 V9GYV3 84 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF788Q6ZQV5 615 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 KLHDC1Q8N7A1 406 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 RAB1CQ92928 201 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 OR8B2Q96RD0 313 aa16.12■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 PRCDQ00LT1 54 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 MPV17L2Q567V2 206 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 RITA1Q96K30 269 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM167BQ9NRX6 74 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF835Q9Y2P0 537 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 LY6HO94772 140 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 NUDT3O95989 172 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 CSN3P07498 182 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 WFDC12Q8WWY7 111 aa16.11■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 PRSS46E5RG02 174 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 TM4SF5O14894 197 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 LHBP01229 141 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 LRRC10Q5BKY1 277 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 hDV102S1A0JD36 115 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 C8orf88P0DMB2 117 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 UQCRFS1P47985 274 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 SMAGPQ0VAQ4 97 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 TPPP3Q9BW30 176 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 A0A0G2JNJ9 132 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 C10orf113Q5VZT2 155 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 Q8N976 141 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 Q9UFV3 132 aa16.1■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 C17orf100A8MU93 164 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 ADIPOQQ15848 244 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 PIP4P1Q86T03 277 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 PAXXQ9BUH6 204 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 CNTFRP26992 372 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM136Q6ZRR5 245 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 GAGE12BA1L429 117 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 IGLL1P15814 213 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 CA7P43166 264 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 UBE2G1P62253 170 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF138P52744 262 aa16.08■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 FAM90A27PA6NNH2 459 aa16.08■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 WT1-ASQ06250 92 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 CD69Q07108 199 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 FOXC1Q12948 553 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 LINC00305Q7Z4B0 112 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 GTSF1LQ9H1H1 148 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 PRR20EP86478 221 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 PRR20CP86479 221 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 PRR20DP86480 221 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 PRR20BP86481 221 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 PRR20AP86496 221 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 LINC00173Q6ZV60 143 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 LINC01560Q8TB33 94 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 CORTO00230 105 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 CGB3P0DN86 165 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 CGB7P0DN87 165 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 PGPA6NDG6 321 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 CNIH1O95406 144 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 EBLN2Q6P2I7 272 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF503Q96F45 646 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 H0YJW9 148 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 RBP4P02753 201 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 LYZP61626 148 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 SSX8Q7RTT4 187 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS2-201ENST00000329078 OR1N2Q8NGR9 330 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms