RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB24Q969Q5 203 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPB9Q9BQS6 159 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 VSIRQ9H7M9 311 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A22Q9H936 323 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF580Q9UK33 172 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 VPREB3Q9UKI3 123 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 RBFOX3A6NFN3 312 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 GNG7O60262 68 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CXorf1O96002 111 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHG2P01859 326 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 IGF1P05019 195 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 KLK9Q2XQG4 91 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM86BQ8N661 226 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 NECAP1Q8NC96 275 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP6V0BQ99437 205 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PRDM13Q9H4Q3 707 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 C21orf62Q9NYP8 219 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 KLK9Q9UKQ9 250 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00869P0C866 280 aa17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 MLANAQ16655 118 aa17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 FBLN7Q53RD9 439 aa17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 KHDC3LQ587J8 217 aa17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ASPHD1Q5U4P2 390 aa17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXL7Q9UJT9 491 aa17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM223BA6NKX1 122 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 YIF1AO95070 293 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CD99P14209 185 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TOR2AQ5JU69 321 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SPSB3Q6PJ21 355 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM223AQ8IWN6 122 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 IQCF2Q8IXL9 164 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 STXBP6Q8NFX7 210 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SUN5Q8TC36 379 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 FUT9Q9Y231 359 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ACANP16112 2415 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GV50 99 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 K7EIM0 57 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 BRI3O95415 125 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV4-59P01825 116 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 Q56UQ5 140 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM209BQ5JX69 171 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 C10orf113Q5VZT2 155 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TXNDC17Q9BRA2 123 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PRSS22Q9GZN4 317 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 YAE1D1Q9NRH1 226 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 GNG13Q9P2W3 67 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM218A2RU14 115 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CD5P06127 495 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM78BQ5VT40 261 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PQLC2Q6ZP29 291 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8WTZ3 238 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 FANCD2OSQ96PS1 177 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM167BQ9NRX6 74 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM160Q9NX00 188 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 VAX2Q9UIW0 290 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 HYPMO75409 117 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 OR2J3O76001 311 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 OR5G3P0C626 314 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 RD3LP0DJH9 198 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF726P1Q15940 193 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF506Q5JVG8 444 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC35B3Q9H1N7 401 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 F8W036 122 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLC1P0CG04 106 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 STAG3L2P0CL84 134 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 STAG3L3P0CL85 134 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 BCL2P10415 239 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP5G2Q06055 141 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 USMG5Q96IX5 58 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 DMRT1Q9Y5R6 373 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-48P01763 117 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 AMY1AP04745 511 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 C8orf88P0DMB2 117 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PLP1P60201 277 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 RHOGP84095 191 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 HAGHQ16775 308 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 OR51G1Q8NGK1 321 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SEC11CQ9BY50 192 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0G2JLM5 398 aa17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms