RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 ETV6P41212 452 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 CBX3Q13185 183 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 PET117Q6UWS5 81 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 NECAP1Q8NC96 275 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 OR4A5Q8NH83 315 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 MCFD2Q8NI22 146 aa3.57□□□□□ -1.84
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PRPF8-211ENST00000574728 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.57□□□□□ -1.84
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PRPF8-211ENST00000574728 TP53RKQ96S44 253 aa3.57□□□□□ -1.84
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PRPF8-211ENST00000574728 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.57□□□□□ -1.84
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PRPF8-211ENST00000574728 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.57□□□□□ -1.84
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PRPF8-211ENST00000574728 C15orf61A6NNL5 157 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 PPP5D1E7EU14 171 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 H0Y980 276 aa3.56□□□□□ -1.84
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PRPF8-211ENST00000574728 OVOL1O14753 267 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 RGS5O15539 181 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 OR2J3O76001 311 aa3.56□□□□□ -1.84
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PRPF8-211ENST00000574728 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
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PRPF8-211ENST00000574728 RAB25P57735 213 aa3.55□□□□□ -1.84
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PRPF8-211ENST00000574728 IL18Q14116 193 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 TMEM187Q14656 261 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 MEF2DQ14814 521 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 SP6Q3SY56 376 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF8-211ENST00000574728 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.55□□□□□ -1.84
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