RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 REG1BP48304 166 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 Q56UQ5 140 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 THAP8Q8NA92 274 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 OR8B2Q96RD0 313 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 E7EUB6 86 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TCF21O43680 179 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 CA7P43166 264 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 GNG5P63218 68 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 PERPQ96FX8 193 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 EPDR1Q9UM22 224 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 COL6A3P12111 3177 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 NDUFB8O95169 186 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-48P01763 117 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 HBBP68871 147 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 MAJINQ3KP22 176 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A1B0GXF2 115 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 M0R296 226 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 CORTO00230 105 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 FSTL3O95633 263 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 PLAUP00749 431 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TNFRSF1AP19438 455 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 MYCNOSP40205 109 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 BLNKQ8WV28 456 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 GPR82Q96P67 336 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 PGPA6NDG6 321 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 CGB1A6NKQ9 187 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 CCL3L1P16619 93 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 ORM2P19652 201 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 C2orf70A6NJV1 201 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 A8MWL6 223 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 CD40P25942 277 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 CCL8P80075 99 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF841Q6ZN19 808 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF596Q8TC21 504 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM186Q96B77 213 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 FMC1Q96HJ9 113 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TNCP24821 2201 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 MOSP00540 346 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 P01737 135 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 CT83Q5H943 113 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TCF24Q7RTU0 167 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 IGLV2-23P01705 113 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 IGLL1P15814 213 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 PTTG1IPP53801 180 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 DEFB123Q8N688 67 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 NUP37Q8NFH4 326 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 SGK494Q96LW2 274 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 COX11Q9Y6N1 276 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A1W2PPI3 338 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 VWC2LB2RUY7 222 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC25A17O43808 307 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 TOMM40O96008 361 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 SSX8Q7RTT4 187 aa7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms