RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531658.1

C11orf58-210, Transcript of chromosome 11 open reading frame 58, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C11orf58, Length 4,258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf58-210ENST00000531658 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 TSPO2Q5TGU0 170 aa4.14□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.14□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 DEFB125Q8N687 156 aa4.14□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.14□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 ZNF721Q8TF20 911 aa4.14□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.14□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.14□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 ZNF286AQ9HBT8 521 aa4.14□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 CREBBPQ92793 2442 aa4.14□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 GGTLC3B5MD39 225 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 BCL2P10415 239 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 ATP6V0CP27449 155 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 STPG4Q8N801 248 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 TSPAN32Q96QS1 320 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 SELENOIQ9C0D9 397 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 CALYQ9NYX4 217 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 CACNG5Q9UF02 275 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 TMEM235A6NFC5 223 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 J3QQQ9 107 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 PGAM2P15259 253 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 TAS2R45P59539 299 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 DAD1P61803 113 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 Q75L30 129 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 ZNF429Q86V71 674 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 CHST6Q9GZX3 395 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 C7orf69Q9H7B7 122 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 EPDR1Q9UM22 224 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 C8orf87E5RJ46 101 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 UPK1AO00322 258 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 UPK1BO75841 260 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 CD3DP04234 171 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 PBOV1Q9GZY1 135 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 PCNX2A6NKB5 2137 aa4.13□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 MEIS3P1A6NDR6 274 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 OVOL1O14753 267 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 MGST3O14880 152 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 C1QL1O75973 258 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 IGKV1-13P0DP09 117 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 ZNF615Q8N8J6 731 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 GABARAPL3Q9BY60 117 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 DOCK7Q96N67 2140 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 A8MXK9 166 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 UBE2L6O14933 153 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 T-ENOLP0DO92 83 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 FOLR2P14207 255 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 LPAR6P43657 344 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 TMEM155Q4W5P6 130 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 FAM120AOSQ5T036 256 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 OR4A5Q8NH83 315 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 OR5AK2Q8NH90 309 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 LINC01560Q8TB33 94 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 M0R1X1 148 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 SOD1P00441 154 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 HRASP01112 189 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 SHBGP04278 402 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 DEFA4P12838 97 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 C12orf74Q32Q52 190 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 DNM1P46Q6ZS02 220 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 LINC00305Q7Z4B0 112 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 CACNA1EQ15878 2313 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 C15orf65H3BRN8 121 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 SLC25A1P53007 311 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 GVQW1Q8N7I0 195 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 ABCA4P78363 2273 aa4.12□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa4.11□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 A0A1W2PS18 150 aa4.11□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 C5orf63A6NC05 138 aa4.11□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 H3BMG7 143 aa4.11□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 K7ERJ3 54 aa4.11□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 TCRAP04437 139 aa4.11□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 ERHP84090 104 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 FAM27BQ5VT28 67 aa4.11□□□□□ -1.75
C11orf58-210ENST00000531658 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms