RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 RND2P52198 227 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 TCTAP57738 103 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 TMEM41BQ5BJD5 291 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 ACTL10Q5JWF8 245 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 OR1S2Q8NGQ3 325 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 Q8WTZ3 238 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 GPR146Q96CH1 333 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 HRH4Q9H3N8 390 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 NAA60Q9H7X0 242 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 CACNG5Q9UF02 275 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 AGRNO00468 2067 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 CEBPZOSA8MTT3 80 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 C11orf94C9JXX5 98 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 RGS5O15539 181 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A4P12235 298 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 MIFP14174 115 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 DHRS2Q13268 280 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 MEF2DQ14814 521 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 C2orf83Q53S99 150 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 TMEM268Q5VZI3 342 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 C16orf54Q6UWD8 224 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 SLC24A4Q8NFF2 622 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 CLEC5AQ9NY25 188 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 APLNQ9ULZ1 77 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 X6R8D5 127 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 HELTA6NFD8 242 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 DISC1C4P0D8 188 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 CTDSP2O14595 271 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 HLA-DMBP28068 263 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 OR10J1P30954 320 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 DHODHQ02127 395 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 PSMG4Q5JS54 123 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 TMEM170AQ8WVE7 144 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 GLMPQ8WWB7 406 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 GPR132Q9UNW8 380 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 DNAH10Q8IVF4 4471 aa12.25□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa12.25□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 NXPH3O95157 252 aa12.25□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.25□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 SMIM4Q8WVI0 70 aa12.25□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 RAB40CQ96S21 281 aa12.25□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 IL4P05112 153 aa12.24□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 ETFRF1Q6IPR1 90 aa12.24□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZTC4 211 aa12.24□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 OR4C16Q8NGL9 310 aa12.24□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 NPIPB3Q92617 1050 aa12.24□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D24Q9ULP9 559 aa12.24□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa12.24□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 VPS13DQ5THJ4 4388 aa12.23□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 AKAIN1P0CW23 69 aa12.23□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 NPY1RP25929 384 aa12.23□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 SPCS2Q15005 226 aa12.23□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 ACY3Q96HD9 319 aa12.23□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 PRR13Q9NZ81 148 aa12.23□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 TRAV10A0A0B4J240 114 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 FAM90A26D6RGX4 464 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 BUB3O43684 328 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 TOMM40O96008 361 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 RD3LP0DJH9 198 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 SULT1A3P0DMM9 295 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 SULT1A4P0DMN0 295 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 IL18Q14116 193 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 NMSQ5H8A3 153 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 CENPSQ8N2Z9 138 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 OR51S1Q8NGJ8 323 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 PRRT1Q99946 306 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 IFNA10P01566 189 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 PSG1P11464 419 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 GPR141Q7Z602 305 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 NOXA1Q86UR1 476 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 DIRAS2Q96HU8 199 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 NRN1Q9NPD7 142 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 CELA1Q9UNI1 258 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-211ENST00000513325 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 CTDSPLO15194 276 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 ZNF767PQ75MW2 155 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 OR51G1Q8NGK1 321 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 IL22RA2Q969J5 263 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 XCL2Q9UBD3 114 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 CACFD1Q9UGQ2 172 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 H3BMM0 161 aa12.19□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
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