RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 SPCS3P61009 180 aa11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 MZT2AQ6P582 158 aa11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 B3GALNT1O75752 331 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 CD3DP04234 171 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 NPY1RP25929 384 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 RORCP51449 518 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 BSXQ3C1V8 233 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 FAM219AQ8IW50 185 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 TERB2Q8NHR7 220 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 U3KQE9 123 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 A0A0G2JRQ6 117 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 IGLC1P0CG04 106 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 P0DMU3 169 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 FAM231AP0DMU4 169 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 FAM231CP0DMU5 169 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 SLC25A4P12235 298 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 UCP1P25874 307 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 OR10J1P30954 320 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 RND2P52198 227 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 C12orf74Q32Q52 190 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF767PQ75MW2 155 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 OR13C8Q8NGS7 320 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 OR52E5Q8NH55 327 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 OR52I2Q8NH67 350 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 GLMPQ8WWB7 406 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 AP3S1Q92572 193 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 NDUFAF3Q9BU61 184 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 XCL2Q9UBD3 114 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 CELA1Q9UNI1 258 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 AMBPP02760 352 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 DHODHQ02127 395 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 PRSS54Q6PEW0 395 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 Q6ZRM9 215 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 NDUFA13Q9P0J0 144 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 MTFP1Q9UDX5 166 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC160A6NGH7 325 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 RAB3DO95716 219 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 IL4P05112 153 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 C2orf83Q53S99 150 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 MARCH1Q8TCQ1 289 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 C15orf40Q8WUR7 153 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM222Q9H0R3 208 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 NRN1Q9NPD7 142 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 EXTL2Q9UBQ6 330 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 VPS13DQ5THJ4 4388 aa11.77□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 CDS2O95674 445 aa11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 OR5AC1P0C628 307 aa11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 RD3LP0DJH9 198 aa11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 TAS2R19P59542 299 aa11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 AARDQ4LEZ3 155 aa11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 NOXA1Q86UR1 476 aa11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 OR4D10Q8NGI6 311 aa11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 ABHD1Q96SE0 405 aa11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 CACNG5Q9UF02 275 aa11.77□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.76□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 H3BMM0 161 aa11.76□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 STEAP1BQ6NZ63 245 aa11.76□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.76□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 NPIPB3Q92617 1050 aa11.76□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 ACY3Q96HD9 319 aa11.76□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 M0R2N4 97 aa11.75□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 BUB3O43684 328 aa11.75□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 CD74P04233 296 aa11.75□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.75□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 EMP1P54849 157 aa11.75□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 GLYATL2Q8WU03 294 aa11.75□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 GPR146Q96CH1 333 aa11.75□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 NAA60Q9H7X0 242 aa11.75□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 CACFD1Q9UGQ2 172 aa11.75□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.75□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 KIAA1109Q2LD37 5005 aa11.75□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa11.74□□□□□ -0.53
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM189A5PLL7 270 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms