RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 SOX2P48431 317 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FHITP49789 147 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 TPPP2P59282 170 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 AESQ08117 197 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FHL3Q13643 280 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 ICAM4Q14773 271 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 PSG3Q16557 428 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 PRSS8Q16651 343 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 DRAM1Q8N682 238 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 TOMM40LQ969M1 308 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 NUDT11Q96G61 164 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 CYYR1Q96J86 154 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 OR10C1Q96KK4 312 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 MS4A10Q96PG2 267 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 VAMP8Q9BV40 100 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 NAT8Q9UHE5 227 aa6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 SORL1Q92673 2214 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 PRSS47A8MTI9 375 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF727A8MUV8 499 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 SERPINE3A8MV23 424 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM250H0YL14 139 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 ST8SIA3O43173 380 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 CDS2O95674 445 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 HRASP01112 189 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 REG1AP05451 166 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 SERPINA2P20848 420 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 RHOGP84095 191 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 GNMTQ14749 295 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 LTC4SQ16873 150 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 MPV17LQ2QL34 196 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM219AQ8IW50 185 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 Q8N1X5 172 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM230Q96A57 120 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 RNF2Q99496 336 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 BET1LQ9NYM9 111 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 COX11Q9Y6N1 276 aa6.06□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 SOX15O60248 233 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 YPEL1O60688 119 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 IGKV1D-33P01593 117 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 IGKV1-33P01594 117 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 CSN2P05814 226 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 GNRHRP30968 328 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 SSTR5P35346 364 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 GPR12P47775 334 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 REG1BP48304 166 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 QRFPP83859 136 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF146Q15072 292 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 Q6P435 159 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 ACSM6Q6P461 480 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 CFAP161Q6P656 301 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.05□□□□□ -1.44
SZRD1-208ENST00000476423 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms