RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 FABP1P07148 127 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 EDN2P20800 178 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 ZNF846Q147U1 533 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 GGNBP1Q5YKI7 109 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 PRSS54Q6PEW0 395 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 MITD1Q8WV92 249 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 GRAMD2BQ96HH9 432 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 METTL26Q96S19 204 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 C20orf85Q9H1P6 137 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 PFDN2Q9UHV9 154 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 CD7P09564 240 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 OR10J1P30954 320 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 RND2P52198 227 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 ASCL2Q99929 193 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 SPATA25Q9BR10 227 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 TM2D3Q9BRN9 247 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 VSIRQ9H7M9 311 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 FLVCR2Q9UPI3 526 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 TRAV2A0A0B4J234 112 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 WRBO00258 174 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1-17P01599 117 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 IGLC1P0CG04 106 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 ID3Q02535 119 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 ASAH1Q13510 395 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 MLANAQ16655 118 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 TMEM170AQ8WVE7 144 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 SLC35E1Q96K37 410 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 NUDT15Q9NV35 164 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 CFDP00746 253 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 RD3LP0DJH9 198 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 CRYBB3P26998 211 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 HAGHQ16775 308 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 NPIPB3Q92617 1050 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 RCHY1Q96PM5 261 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 RNF2Q99496 336 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 ADAP1O75689 374 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 UPK1BO75841 260 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 TOMM40O96008 361 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 S100A7P31151 101 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 TIGITQ495A1 244 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 DEFB125Q8N687 156 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 ACY3Q96HD9 319 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 RAB40CQ96S21 281 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 HELTA6NFD8 242 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 ZFP92A6NM28 416 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 DFFBO76075 338 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 10
PRAME-211ENST00000476336 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 IAPPP10997 89 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 TAS2R30P59541 319 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 GAMTQ14353 236 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 TCF24Q7RTU0 167 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 OR4D5Q8NGN0 318 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 SMIM8Q96KF7 97 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-211ENST00000476336 SNRPGP15A8MWD9 76 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 IL4P05112 153 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 APOC4P55056 127 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 DEFA1P59665 94 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 DEFA3P59666 94 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 OR8G2PQ6IF36 304 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 ENKURQ8TC29 256 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 ST8SIA2Q92186 375 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 TRGV9Q99603 122 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 RABAC1Q9UI14 185 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 UBE2CO00762 179 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 TSC22D2O75157 780 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 IL5P05113 134 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms