RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 NMSQ5H8A3 153 aa11.15□□□□□ -0.62
CTSW-201ENST00000307886 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CTSW-201ENST00000307886 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.15□□□□□ -0.62
CTSW-201ENST00000307886 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.15□□□□□ -0.62
CTSW-201ENST00000307886 NUPR2A6NF83 97 aa11.14□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 DCANP1Q8TF63 244 aa11.14□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 RARRES2Q99969 163 aa11.14□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
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CTSW-201ENST00000307886 OR11H2Q8NH07 326 aa11.13□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 IL22RA2Q969J5 263 aa11.13□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 METTL26Q96S19 204 aa11.13□□□□□ -0.63
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CTSW-201ENST00000307886 RABL2BQ9UNT1 228 aa11.13□□□□□ -0.63
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CTSW-201ENST00000307886 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
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CTSW-201ENST00000307886 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
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CTSW-201ENST00000307886 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.12□□□□□ -0.63
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CTSW-201ENST00000307886 STHQ8IWL8 128 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 Q8NAQ8 132 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 RBKSQ9H477 322 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 MCUBQ9NWR8 336 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 VPS13DQ5THJ4 4388 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 PITX3O75364 302 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
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CTSW-201ENST00000307886 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 CCR6P51684 374 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 MCFD2Q8NI22 146 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 C11orf45Q8TAV5 145 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 DTD1Q8TEA8 209 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 ACY3Q96HD9 319 aa11.09□□□□□ -0.63
CTSW-201ENST00000307886 RAB40CQ96S21 281 aa11.09□□□□□ -0.63
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CTSW-201ENST00000307886 TOMM40O96008 361 aa11.08□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 IFNA10P01566 189 aa11.08□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 IL4P05112 153 aa11.08□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 PSG1P11464 419 aa11.08□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 ZNF79Q15937 498 aa11.08□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.08□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 U3KQ87 197 aa11.08□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 V9GYH0 126 aa11.08□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 RD3LP0DJH9 198 aa11.07□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 DHRS2Q13268 280 aa11.07□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 GAMTQ14353 236 aa11.07□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.07□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.07□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 LGI3Q8N145 548 aa11.07□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 CACFD1Q9UGQ2 172 aa11.07□□□□□ -0.64
CTSW-201ENST00000307886 X6R8D5 127 aa11.07□□□□□ -0.64
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