RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 TNFRSF9Q07011 255 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 CD69Q07108 199 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 GUCA2BQ16661 112 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 NMSQ5H8A3 153 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 LYG2Q86SG7 212 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 NOXA1Q86UR1 476 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 DTD1Q8TEA8 209 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ATP6V0BQ99437 205 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 TXN2Q99757 166 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 RBKSQ9H477 322 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 I3L2K1 104 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 WRBO00258 174 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 NDUFA4O00483 81 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 PLA2G10O15496 165 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 MED6O75586 246 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 TCRBP04435 133 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 FOLR2P14207 255 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 CBLN1P23435 193 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 NPY1RP25929 384 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 BTCP35070 178 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 DHRS2Q13268 280 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 TM4SF20Q53R12 229 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ETFRF1Q6IPR1 90 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 LRTM2Q8N967 370 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.91□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 A8MWP6 167 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ADAP1O75689 374 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 UPK1BO75841 260 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SCGB1D2O95969 90 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 IFNA4P05014 189 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 CTSGP08311 255 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 IAPPP10997 89 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 EDN2P20800 178 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 RPP30P78346 268 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 AARDQ4LEZ3 155 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 C2orf83Q53S99 150 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 IL34Q6ZMJ4 242 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ENKURQ8TC29 256 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 MARC2Q969Z3 335 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 NUDT15Q9NV35 164 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 U3KQ87 197 aa5.9□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 HERC1Q15751 4861 aa5.9□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 TMEM213A2RRL7 107 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 FAM25EA8MYX2 175 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 F8W735 103 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 SYNGR2O43760 224 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 TMEM50AO95807 157 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 SLC25A4P12235 298 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 SLC25A6P12236 298 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 ADMP35318 185 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 DEFA1P59665 94 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 DEFA3P59666 94 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 RAB11AP62491 216 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 MLANAQ16655 118 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 BSXQ3C1V8 233 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 BTNL8Q6UX41 500 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 GINS3Q9BRX5 216 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 MLXQ9UH92 298 aa5.89□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.88□□□□□ -1.47
SMG6-211ENST00000572369 C15orf62A8K5M9 175 aa5.88□□□□□ -1.47
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