RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF718Q3SXZ3 478 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 NRN1LQ496H8 165 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TPPP3Q9BW30 176 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 H3BUT2 72 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SMPD2O60906 423 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 FOXF2Q12947 444 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 RPL39P5Q59GN2 51 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM108Q6UXF1 575 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TCF24Q7RTU0 167 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 OR52E5Q8NH55 327 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 RAB1CQ92928 201 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 MPDU1O75352 247 aa13.33□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 WT1P19544 449 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TM4SF20Q53R12 229 aa13.33□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 Q6P435 159 aa13.33□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 C5orf30Q96GV9 206 aa13.33□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 NABP2Q9BQ15 211 aa13.33□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 MMP23AO75900 390 aa13.33□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB109BQ30KR1 87 aa13.33□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 HIGD1CA8MV81 97 aa13.33□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 BLNKQ8WV28 456 aa13.33□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 MORN2Q502X0 79 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 S1PR3Q99500 378 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 TCF19Q9Y242 345 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV5A0A0B4J249 113 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 IZUMO1RA6ND01 250 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 SPINT2O43291 252 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 CIDEAO60543 219 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 COX19Q49B96 90 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 OSTCQ9NRP0 149 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 MLANAQ16655 118 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G2CQ5R387 149 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM167BQ9NRX6 74 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 C9JCJ5 164 aa13.31□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 H3BTX0 84 aa13.31□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 HTR1DP28221 377 aa13.31□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 VWC2Q2TAL6 325 aa13.31□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 OR1B1Q8NGR6 318 aa13.31□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 METRNQ9UJH8 293 aa13.31□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 FAM231BA6NCW3 169 aa13.31□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 BRWD1-AS2P59051 145 aa13.31□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 PGLYRP4Q96LB8 373 aa13.31□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 CHEK1O14757 476 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00596Q86U02 117 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N7P7 452 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 NUP35Q8NFH5 326 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 ATMQ13315 3056 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 OR13A1Q8NGR1 328 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM140Q9NV12 185 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 GPR183P32249 361 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 SMAGPQ0VAQ4 97 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf106Q8NAJ2 232 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 OR2V2Q96R30 315 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 AKAP13Q12802 2813 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 OOEPA6NGQ2 149 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 GGTLC3B5MD39 225 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 PLP1P60201 277 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 FAM214BQ7L5A3 538 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB34Q8NCN2 500 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 ARF6P62330 175 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 DYSFO75923 2080 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 APC2O95996 2303 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 H0YJW9 148 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 TAS2R45P59539 299 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 GNG5P63218 68 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 GFRA3O60609 400 aa13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 PYYP10082 97 aa13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB125Q8N687 156 aa13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 OR8A1Q8NGG7 326 aa13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 CEP295Q9C0D2 2601 aa13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 ISLRO14498 428 aa13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 FTH1P19P0C7X4 201 aa13.27□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 CUL9Q8IWT3 2517 aa13.27□□□□□ -0.28
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PRE2 83 aa13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms