RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 BTNL2Q9UIR0 455 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 MED31Q9Y3C7 131 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A0J9YY99 117 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1B0GTI1 187 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 PRORSD1PA6NEY8 169 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 SMIM9A6NGZ8 99 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 C9JCJ5 164 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF878C9JN71 531 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 RPP14O95059 124 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 TNFAIP8O95379 198 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 NRASP01111 189 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 HBE1P02100 147 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP5G1P05496 136 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 FCGR3AP08637 254 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 PSKH1P11801 424 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 CRYGAP11844 174 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 IFI30P13284 250 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 S100A3P33764 101 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP5G3P48201 142 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF137PP52743 207 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP6V1FQ16864 119 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 TEX30Q5JUR7 227 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC25A30Q5SVS4 291 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 CLVS2Q5SYC1 327 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 FUNDC1Q8IVP5 155 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 C1orf158Q8N1D5 194 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 MS4A14Q96JA4 679 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 CABLES2Q9BTV7 478 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC00574Q9H8X3 128 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 TVP23BQ9NYZ1 205 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM216Q9P0N5 145 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 PQLC2LA1A4F0 135 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM231BA6NCW3 169 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 M0QXV9 152 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 SULT1C2O00338 296 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 LECT2O14960 151 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ENTPD6O75354 484 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 TSHBP01222 138 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 RPSAP08865 295 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 HSD17B1P14061 328 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC2A5P22732 501 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 CEBPGP53567 150 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 DHODHQ02127 395 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ACTL10Q5JWF8 245 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 MEDAGQ5VYS4 303 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 AHSA2Q719I0 299 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM220AQ7Z4H9 259 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM24BQ8N5W8 94 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 SAMD12Q8N8I0 201 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF738Q8NE65 137 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 OR4D11Q8NGI4 311 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 OR10G8Q8NGN5 311 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 OR6K6Q8NGW6 343 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 OR2G2Q8NGZ5 317 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM80Q96HE8 168 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 SEC22AQ96IW7 307 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ST6GAL2Q96JF0 529 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 OR2A7Q96R45 310 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 TPT1P8Q9HAU6 139 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF446Q9NWS9 450 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 V9GYQ6 96 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 KMT2DO14686 5537 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A087WUU8 490 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 RBFOX3A6NFN3 312 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 TVP23AA6NH52 213 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 EFCAB9A8MZ26 197 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 SERPINB7O75635 380 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 CCNKO75909 580 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 IGKV1D-12P01611 117 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 APOC1P02654 83 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 CSN2P05814 226 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 HLA-GP17693 338 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 HLA-DMAP28067 261 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 GSSP48637 474 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-203ENST00000459697 TAS2R41P59536 307 aa2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms